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• PairResiduesByNum() : ost.mol.alg.views
• PairwiseDistancesFromTraj() : ost.mol.alg.trajectory_analysis
• ParaGlobalAlign() : ost::seq::alg
• ParaLocalAlign() : ost::seq::alg
• ParasailAvailable() : ost::seq::alg
• ParaSemiGlobalAlign() : ost::seq::alg
• PariwiseDistanceMatrix() : ost::mol::alg
• parse_script_option() : ost.gui.dng.init
• ParseA3M() : ost.bindings.hhblits2 , ost.bindings.hhblits3
• ParseAtomNames() : ost.mol.alg.superpose
• ParseBlastOutput() : ost.bindings.blast
• ParseHeaderLine() : ost.bindings.hhblits2 , ost.bindings.hhblits3
• ParseHHblitsOutput() : ost.bindings.hhblits2 , ost.bindings.hhblits3
• ParseHHM() : ost.bindings.hhblits2 , ost.bindings.hhblits3
• PDBStringToEntity() : ost::io
• PickColor() : ost::gui
• PopVerbosityLevel() : ost::gui
• PredictContacts() : ost::seq::alg
• PreparelDDTGlobalRDMap() : ost::mol::alg
• PrepareSSData() : ost::mol::alg
• PrintGlobalRDMap() : ost::mol::alg
• PrintlDDTPerResidueStats() : ost::mol::alg
• PrintResidueRDMap() : ost::mol::alg
• PropertyFromString() : ost::mol
• PropertyIDFromString() : ost::mol
• PushVerbosityLevel() : ost::gui