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• AlignmentFromChainView() : ost::seq::alg
• AlignmentFromSequenceList() : ost::seq
• AlignmentFromStream() : ost::io
• AlignmentFromString() : ost::io
• AlignmentToString() : ost::io
• AlignToSEQRES() : ost::seq::alg
• AminoAcidToResidueName() : ost::conop
• AnalyzeAlphaHelixAxis() : ost::mol::alg
• AnalyzeAngle() : ost::mol::alg
• AnalyzeAromaticRingInteraction() : ost::mol::alg
• AnalyzeAtomPos() : ost::mol::alg
• AnalyzeBestFitLine() : ost::mol::alg
• AnalyzeBestFitPlane() : ost::mol::alg
• AnalyzeCenterOfMassPos() : ost::mol::alg
• AnalyzeDihedralAngle() : ost::mol::alg
• AnalyzeDistanceBetwAtoms() : ost::mol::alg
• AnalyzeDistanceBetwCenterOfMass() : ost::mol::alg
• AnalyzeHelicity() : ost::mol::alg
• AnalyzeHelixKink() : ost::mol::alg::helix_kinks
• AnalyzeMinDistance() : ost::mol::alg
• AnalyzeMinDistanceBetwCenterOfMassAndView() : ost::mol::alg
• AnalyzeRMSD() : ost::mol::alg
• AnalyzeRMSF() : ost::mol::alg
• Angle() : geom
• AreIntersecting() : geom
• AreParallel() : geom
• AssignBackboneTorsions() : ost::conop
• AssignDSSP() : ost::bindings::dssp
• AverageDistanceMatrixFromTraj() : ost::mol::alg::trajectory_analysis
• AxisRotation() : geom