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• PairwiseDistancesFromTraj() : ost::mol::alg::trajectory_analysis
• PariwiseDistanceMatrix() : ost::mol::alg
• parse_script_option() : ost::gui::dng::init
• ParseA3M() : ost::bindings::hhblits
• ParseAtomNames() : ost::mol::alg::superpose
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• PDBStringToEntity() : ost::io
• PickColor() : ost::gui
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• PredictContacts() : ost::seq::alg
• PreparelDDTGlobalRDMap() : ost::mol::alg
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• PrintGlobalRDMap() : ost::mol::alg
• PrintlDDTPerResidueStats() : ost::mol::alg
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• PropertyFromString() : ost::mol
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• PushVerbosityLevel() : ost::gui