Here is a list of all struct and union fields with links to the structures/unions they belong to:

- g -

• g : RasterImage::Pixel , Units
• gap_extension_penalty : AlignmentOpts
• gap_open_penalty : AlignmentOpts
• GaussianFilterBase() : GaussianFilterBase
• GaussianGradientMagnitudeFilterBase() : GaussianGradientMagnitudeFilterBase
• GaussianHighPassFilter() : GaussianHighPassFilter
• GaussianLaplacianFilterBase() : GaussianLaplacianFilterBase
• GaussianLowPassFilter() : GaussianLowPassFilter
• GaussianSmooth() : Table
• gdt_1() : ReprResult
• gdt_2() : ReprResult
• gdt_4() : ReprResult
• gdt_8() : ReprResult
• gdt_ha : TMScoreResult , GDTResult
• gdt_ts : GDTResult , TMScoreResult
• gdtha() : Scorer
• gdtts() : Scorer
• Generate() : Spline , IsosurfaceGenerator , IsosurfaceGeneratorS
• generate_disulfid_bonds : Settings
• GenerateDisulfidBonds() : Modeller
• GenericProp() : GenericPropContainerImpl
• GenericPropContainer< SequenceHandle > : SequenceHandle
• GenericPropContainerImpl() : GenericPropContainerImpl
• GenericPropError() : GenericPropError
• GenProp() : GenProp
• GeomException() : GeomException
• Get() : IOProfileRegistry , EntityPropertyMapper , Dist2Mean , MeanlDDT , TriMatrix< T > , IOProfiles , RemoteRepository
• get() : AdjacencyBitmap
• get_block_edit_mode_() : PythonShellWidget
• get_intercept_x_values_() : PolygonMask
• GetA() : Ellipse2 , Hyperbola2 , ButterworthLowPassFilter
• GetAALines() : GfxObj , LineRenderOptions
• GetAbsoluteOrigin() : ImageStateImpl< T, D > , ImageHandle , ConstImageHandle , ImageStateBase
• GetActions() : FileBrowser , MessageWidget , SequenceViewer , Widget
• GetActiveNode() : SceneSelection
• GetActiveNodeCount() : SceneSelection
• GetActiveOverlay() : OverlayManager
• GetActiveTool() : ToolManager
• GetActiveView() : SceneSelection
• GetActiveViewCount() : SceneSelection
• GetAddRuleAnchors() : GromacsBlockModifier
• GetAddRuleCharge() : GromacsBlockModifier
• GetAddRuleMethod() : GromacsBlockModifier
• GetAddRuleNames() : GromacsBlockModifier
• GetAddRuleNumber() : GromacsBlockModifier
• GetAddRuleType() : GromacsBlockModifier
• GetAdjMap() : Domains
• GetAdjustedClashingDistance() : ClashingDistances
• GetAdjustedReferenceDistance() : ClashEvent
• GetAlgorithmName() : MirrorFnc , ShiftFnc , TransformFnc , AutoCorrelateFnc , ConjFnc , ExplicitConvoluteFnc , ExplicitCorrelateFnc , SliceFnc , DiscreteShrinkFnc , FFTFnc , GaussianFilterBase , GaussianGradientMagnitudeFilterBase , GaussianLaplacianFilterBase , HighestPeakSearch3DBase , HistogramBase , LineAverageBase , LocalSigmaThresholdBase , MaskImageBase , PowerSpectrumFnc , RandomizeFnc , SmoothMaskImageBase , StatBase , StatMinMaxBase , CosFnc , ExpFnc , LogFnc , Log10Fnc , SinFnc , SqrtFnc , TanFnc , PowFnc , NormalizeFnc , PasteFnc
• GetAlignedLength() : TMAlignResult , MMAlignResult
• GetAlignedSeq() : MMCifInfoStructRef
• GetAlignedSeqs() : MMCifInfoStructRef
• GetAlignment() : TMAlignResult , AlignmentViewObject , QSscoreEntity
• GetAlignmentForRow() : SequenceModel
• GetAlignmentHandle() : AlignedRegion
• GetAlignments() : MMAlignResult
• GetAllowedRange() : StereoChemicalBondViolation , StereoChemicalAngleViolation
• GetAlpha() : Color
• GetAlphaHelixContent() : CoordFrame
• GetAltAtomBFactor() : ResidueImpl
• GetAltAtomGroupNames() : ResidueImpl , ResidueHandle
• GetAltAtomOcc() : ResidueImpl
• GetAltAtomPos() : ResidueImpl , ResidueHandle
• GetAltBFactor() : AtomBase
• GetAltGroupNames() : AtomBase
• GetAltOcc() : AtomBase
• GetAltPos() : AtomBase
• GetAmbientOcclusion() : Scene
• GetAmbientOcclusionMode() : Scene
• GetAmbientOcclusionQuality() : Scene
• GetAmbientOcclusionSize() : Scene
• GetAmbientOcclusionWeight() : Scene
• GetAngle() : Quat , CoordFrame , EntityHandle , EntityView , EntityImpl , TorsionImpl , Forcefield , TorsionHandle
• GetAngleCount() : StereoChemistryInfo
• GetAngleICS() : Dihedral , EntityImpl
• GetAngles() : BuildingBlock , GromacsBlockModifier , QSscoreEntity
• GetAngleViolationList() : StereoChemistryInfo
• GetAngleWidth() : StereoChemicalAngleViolation
• GetAngleXCS() : Dihedral , EntityImpl
• GetAnisou() : AtomBase , AtomImpl
• GetAntialiasing() : DataViewerPanelBase
• GetArcDetail() : PrimList , CartoonRenderOptions , CustomRenderOptions , TraceRenderOptions
• GetArea() : Rectangle2 , Polygon2 , Ellipse2 , Circle2
• GetAspect() : Scene
• GetAssemblies() : LinearIndexer
• GetAssignTorsions() : Processor
• GetAsymIdx() : MMCifWriterEntity
• GetAtom() : Diag , FragmentImpl
• GetAtom1() : MMCifInfoEntityBranchLink
• GetAtom2() : MMCifInfoEntityBranchLink
• GetAtomCount() : ChainHandle , ChainView , CoordGroupHandle , CoordSource , EntityHandle , EntityView , ChainImpl , EntityImpl , ResidueImpl , ResidueHandle , ResidueView
• GetAtomList() : ChainHandle , CoordGroupHandle , CoordSource , EntityHandle , EntityView , ResidueImpl , ResidueHandle , ResidueView
• GetAtomName() : UniqueAtomIdentifier
• GetAtomPos() : CoordFrame , CoordGroupHandle , CoordSource
• GetAtomPosList() : EntityHandle
• GetAtomProps() : SelNode
• GetAtomRenaming() : Forcefield
• GetAtomRenamingRules() : Forcefield
• GetAtoms() : Measurement , BuildingBlock , Interaction , NotConnectedError
• GetAtomSpecIndex() : Compound
• GetAtomSpecs() : Compound
• GetAtomType() : Forcefield
• GetAttachedView() : SequenceImpl , ConstSequenceHandle , SequenceHandle
• GetAttribute() : InfoGroup , InfoHandle , EleImpl , InfoItem , StarWriterDataItem
• GetAttributeList() : InfoGroup , InfoHandle , EleImpl , InfoItem
• GetAU() : OMF
• GetAUChain() : OMF
• GetAUChains() : BUInfo
• GetAuthorList() : MMCifInfoCitation
• GetAutoAutoslab() : Scene
• GetAutoslabMode() : Scene
• GetAvailableAlignmentHandler() : IOManager
• GetAvailableEntityHandler() : IOManager
• GetAvailableMapHandler() : IOManager
• GetAvailableProfileHandler() : IOManager
• GetAvailableSurfaceHandler() : IOManager
• GetAvailableWidgets() : PanelManager , WidgetPool
• GetAvailableWidgetsMenu() : PanelManager
• GetAverage() : Distances
• GetAverageBFactor() : ResidueImpl
• GetAverageEntropy() : ProfileHandle
• GetAverageOffset() : ClashingInfo
• GetAverageScore() : ProfileHandle
• GetAvgBFactors() : OMF
• GetAvgBondLengthInfo() : StereoChemistryInfo
• GetAvgLength() : BondLengthInfo
• GetAvgZscore() : BondLengthInfo
• GetAvgZscoreAngles() : StereoChemistryInfo
• GetAvgZscoreBonds() : StereoChemistryInfo
• GetAxis() : Quat , QSscoreEntity
• GetAxisA() : Cuboid
• GetAxisB() : Cuboid
• GetAxisC() : Cuboid
• GetB() : Ellipse2 , Hyperbola2
• GetBackground() : Scene
• GetBackgroundStereoMode() : Scene
• GetBackgroundStereoOffset() : Scene
• GetBadAngleCount() : StereoChemistryInfo
• GetBadBondCount() : StereoChemistryInfo
• GetBasedir() : MMPreprocessor
• GetBFactor() : AtomBase , AtomImpl
• GetBFactors() : OMF
• GetBias() : ContextProfile
• GetBins() : HistogramBase
• GetBioUnits() : MMCifInfo
• GetBitDepth() : DAT , IPL , MRC , TIF , DAT , IPL , MRC , TIF
• GetBlockModifier() : Forcefield
• GetBlockModifierType() : HydrogenConstructor , TerminiConstructor , BlockModifier , GromacsHydrogenConstructor , GromacsBlockModifier , HeuristicHydrogenConstructor , HeuristicBlockModifier
• GetBlocksize() : DiscreteShrinkFnc
• GetBlue() : Color
• GetBlurFactors() : SimpleRenderOptions
• GetBlurFlag() : SimpleRenderOptions
• GetBond() : Forcefield
• GetBondCount() : StereoChemistryInfo , AtomHandle , AtomView , ChainHandle , ChainView , EntityHandle , EntityView , ChainImpl , EntityImpl , ResidueImpl , ResidueHandle
• GetBondEntryList() : LineTraceRenderer , SimpleRenderer
• GetBondLength() : StereoChemicalBondViolation
• GetBondList() : AtomHandle , AtomView , EntityHandle , EntityView , EntityImpl
• GetBondOrder() : MMCifInfoEntityBranchLink , BondHandle , ConnectorImpl
• GetBondOrderDistance() : SimpleRenderOptions
• GetBondOrderFlag() : SimpleRenderOptions
• GetBondPartners() : AtomHandle , AtomView
• GetBondRad() : CustomRenderOptions
• GetBonds() : BuildingBlock , GromacsBlockModifier
• GetBondSpecs() : Compound
• GetBondViolationList() : StereoChemistryInfo
• GetBookPublisher() : MMCifInfoCitation
• GetBookPublisherCity() : MMCifInfoCitation
• GetBoolProp() : ConstGenericPropContainer< H >
• GetBoolRepr() : EleImpl
• GetBoundingBox() : Polygon2 , Ellipse2 , Entity , GfxObj , GfxTestObj , CartoonRenderer , ConnectRendererBase , EntityRenderer , TraceRendererBase , MapIso , MapSlab , PrimList , Scene , Surface , IndexedVertexArray
• GetBoundObject() : QueryState
• GetBounds() : ChainHandle , ChainView , EntityHandle , EntityView , ChainImpl , EntityImpl , ResidueImpl , ResidueHandle , ResidueView
• GetBrush() : SymbolDrawingStrategy
• GetBuildingBlock() : Forcefield
• GetBuildingBlockNames() : Forcefield
• GetButtonGroup() : DataViewer , OverlayManagerGUI
• GetButtons() : MouseEvent
• GetCalculateMinMax() : GradientColorOp
• GetCarbonsOnly() : ColorOptionsWidget
• GetCAS() : MMCifInfoCitation
• GetCASPFlag() : MMCifInfoStructDetails
• GetCategory() : StarDataItem , StarLoopDesc , StarWriterDataItem , StarWriterLoopDesc , StarDataItem , StarLoopDesc , StarWriterDataItem , StarWriterLoopDesc
• GetCellAngles() : CoordFrame
• GetCellSize() : BaseRow , CoordFrame
• GetCellVectors() : CoordFrame
• GetCenter() : AlignedCuboid , Circle2 , Cuboid , PointCloud , Transform , Vec3List , GfxObj , GfxObjBase , GfxTestObj , MapIso , MapSlab , PrimList , Scene , Extent , WithinParam
• GetCenterOfAtoms() : ChainHandle , ChainView , EntityHandle , EntityView , ChainImpl , EntityImpl , ResidueImpl , ResidueHandle , ResidueView
• GetCenterOfMass() : StatBase , ChainHandle , ChainView , EntityHandle , EntityView , ChainImpl , EntityImpl , ResidueImpl , ResidueHandle , ResidueView
• GetCenterOfMassPos() : CoordFrame
• GetCentralAtom() : ResidueImpl , ResidueBase
• GetCentralNormal() : ResidueImpl , ResidueBase
• GetCentroid() : Polygon2
• GetChain() : Diag , SecStrRow , EntityImpl , ResidueImpl , ResidueHandle , ResidueView , ContactEntity , QSEntity
• GetChainCount() : ByChainColorOp , EntityHandle , EntityView , EntityImpl
• GetChainIntervalList() : MMCifInfoBioUnit
• GetChainIter() : EntityImpl
• GetChainLengths() : LinearIndexer
• GetChainList() : MMCifInfoBioUnit , EntityHandle , EntityView , EntityImpl
• GetChainName() : MMCifInfoStructRefSeq , UniqueAtomIdentifier
• GetChainNames() : LinearIndexer , OMF
• GetChainView1() : _CachedRMSD
• GetChainView2() : _CachedRMSD
• GetCharacter() : LinearCharacterContainer
• GetCharacters() : LinearCharacterContainer
• GetCharge() : AtomBase , AtomImpl , BuildingBlock , Topology
• GetCharges() : BuildingBlock , Topology
• GetCheckBondFeasibility() : Processor
• GetCheckedValue() : ImageStateImpl< T, D >
• GetChemClass() : Compound , ResidueImpl , ResidueBase
• GetChemMapping() : ChainMapper
• GetChemType() : Compound , ResidueImpl , ResidueBase
• GetChiDefinitions() : ResidueDefinition
• GetChild() : SceneNode
• GetChildCount() : GfxNode , OctreeNode
• GetChildren() : GfxNode
• GetChildRow() : SceneNode
• GetCircumference() : Circle2
• GetCitations() : MMCifInfo
• GetCitationType() : MMCifInfoCitation
• GetClamp() : GradientColorOp
• GetClashCount() : ClashingInfo
• GetClashingDistance() : ClashingDistances
• GetClashList() : ClashingInfo
• GetClickedPosition() : DataViewerPanelBase
• GetClip() : GfxObj , GfxObjBase
• GetClipOffset() : IndexedVertexArray , GfxObj , GfxObjBase
• GetClipPlane() : GfxObj , GfxObjBase
• GetCMap() : Forcefield
• GetCMapIndices() : Topology
• GetCMapParameters() : Topology
• GetCMaps() : BuildingBlock , Topology
• GetCmaps() : GromacsBlockModifier
• GetCodeBlockStatus() : PythonInterpreter
• GetCodeLogging() : TextLogger
• GetCol() : Mat3
• GetColIndex() : Table
• GetColNames() : Table
• GetColor() : ByChainColorOp , UniformColorOp , Gradient::Stop , MapIso , IndexedVertexArray , Measurement , MeasureTool , ColorSelectWidget
• GetColorAt() : Gradient
• GetColorBlendMode() : CartoonRenderOptions
• GetColorMode() : DataViewerPanelBase
• GetColumnCount() : EntityPartNode , GfxSceneNode , LabelNode , RenderModeNode , RootNode , SceneNode , BaseRow , SequenceRow
• GetColumns() : ProfileHandle
• GetCommand() : InputEvent , PythonContextParser , PythonShellWidget , ShellHistory
• GetCommandMode() : ShellHistory
• GetComment() : InfoGroup , EleImpl , InfoItem
• GetCommonMatch() : OstCompleterBase
• GetComplex() : ConstData , ImageHandle , ConstImageHandle , ImageStateBase , FrequencyDomain , HalfFrequencyDomain , ImageStateImpl< T, D > , SpatialDomain , NullData
• GetComponents() : Domains
• GetCompOP() : SelNode
• GetConnect() : Processor
• GetConnectAminoAcids() : Processor
• GetConnectHetatm() : Processor
• GetConnectorCount() : AtomImpl
• GetConstraint() : Forcefield
• GetConstraints() : BuildingBlock
• GetContextAtLocation() : PythonContext , PythonContextParser
• GetContextMenu() : SceneWin
• GetCount() : BondLengthInfo , AlignmentHandle , SequenceListImpl , ConstSequenceList , SequenceList
• GetCoverage() : AlignmentHandle , SequenceListImpl
• GetCreationDate() : Compound , CompoundLib
• GetCrosshair() : PointlistOverlayBase
• GetCTerModifier() : Forcefield
• GetCurrentAltGroupName() : ResidueImpl , ResidueHandle
• GetCurrentDisplayMode() : BaseViewObject , SequenceModel , SequenceViewer
• GetCurrentLinenum() : StarParser
• GetCurrentName() : Shader
• GetCurrentOMFVersion() : OMF
• GetCurrentProgram() : Shader
• GetCurrentSink() : Logger
• GetCurrentWidget() : ComboOptionsWidget
• GetCustomViewNode() : EntityNode
• GetData() : DataViewer , EntityPartNode , GfxSceneNode , LabelNode , RenderModeNode , RootNode , SceneNode , AlignmentViewObject , BaseRow , BaseViewObject , SecStrRow , SequenceRow , TitleRow , ValueHolder< V > , StarWriterLoop , ContextProfile
• GetDataElement() : Distances
• GetDataMax() : DataViewerPanelBase
• GetDataMin() : DataViewerPanelBase
• GetDataPtr() : RasterImage
• GetDataRange() : LinearIndexer
• GetDataSize() : Distances
• GetDataType() : ValueHolder< V >
• GetDate() : MMCifInfoObsolete , MMCifInfoRevisions , MMCifInfoObsolete , MMCifInfoRevisions
• GetDateOriginal() : MMCifInfoRevisions
• GetDBAccess() : MMCifInfoStructRef
• GetDBBegin() : MMCifInfoStructRefSeq
• GetDBEnd() : MMCifInfoStructRefSeq
• GetDBID() : MMCifInfoStructRef
• GetDBName() : MMCifInfoStructRef
• GetDBRNum() : MMCifInfoStructRefSeqDif
• GetDefault() : ToolOptionNum< T, C > , IOProfileRegistry
• GetDefaultGroup() : InfoHandle
• GetDefaultItem() : InfoHandle
• GetDefaultLib() : Conopology
• GetDefaultProps() : AtomProp
• GetDefaultQueryFlags() : EntityHandle , EntityImpl
• GetDefaultSize() : GostyMainWindow , SequenceDelegate
• GetDefaultTextSize() : Scene
• GetDeleteAtoms() : GromacsBlockModifier
• GetDeletions() : InsDel
• GetDelim() : PythonTokenizer
• GetDelta() : InputEvent , MouseEvent , CoordGroupHandle
• GetDepth() : Extent , Size
• GetDesc() : StarWriterLoop
• GetDescription() : ChainBase , ChainImpl
• GetDescriptor() : MMCifInfoStructDetails
• GetDetails() : MMCifInfoBioUnit , MMCifInfoStructRefSeqDif , MMCifInfoBioUnit , MMCifInfoStructRefSeqDif
• GetDevice() : InputEvent
• GetDialect() : Compound
• GetDialectAsString() : Compound
• GetDifs() : MMCifInfoStructRefSeq
• GetDihedralAngle() : CoordFrame
• GetDihedrals() : BuildingBlock , Forcefield , GromacsBlockModifier
• GetDim() : Extent , Size
• GetDir() : ConnectorImpl
• GetDirection() : Line2 , Line3
• GetDisplayAlignment() : SelectRefDialog
• GetDisplayModes() : BaseViewObject , SequenceModel , SequenceViewer
• GetDisplayPixelValues() : DataViewerPanelBase
• GetDistanceBetwAtoms() : CoordFrame
• GetDistanceBetwCenterOfMass() : CoordFrame
• GetDistanceConstraintIndex() : Topology
• GetDistanceConstraintIndices() : Topology
• GetDistanceConstraintParameters() : Topology
• GetDistanceConstraints() : Topology
• GetDistances() : DistanceMap
• GetDocument() : InfoImpl
• GetDOI() : MMCifInfoCitation
• GetDomain() : ConstData , ImageHandle , ConstImageHandle , ImageStateBase , FrequencyDomain , HalfFrequencyDomain , ImageStateImpl< T, D > , SpatialDomain , NullData
• GetDomains() : Domains
• GetDownsampledMap() : MapIso
• GetEditStartBlock() : PythonShellWidget
• GetEffectiveView() : EntityRenderer
• GetElement() : EleImpl , AtomBase , AtomImpl
• GetEMResolution() : MMCifInfo
• GetEnd() : Rectangle2 , Extent , ExtentIterator , ValueHolder< V > , AlignedRegion
• GetEndianess() : DAT
• GetEndianessOnSave() : MRC , Spider , MRC , Spider
• GetEnergy() : Simulation
• GetEnt1MappedChains() : MMAlignResult
• GetEnt2MappedChains() : MMAlignResult
• GetEntities() : MMCifWriter , SelectRefDialog
• GetEntity() : Entity , EntityPartNode , OMF , AtomHandle , AtomView , ChainHandle , ChainView , CoordGroupHandle , CoordSource , EditorBase , AtomImpl , ChainImpl , ResidueImpl , Simulation , QueryViewWrapper , ResidueHandle , ResidueView
• GetEntityBranchByChain() : MMCifInfo
• GetEntityBranchChainNames() : MMCifInfo
• GetEntityBranchChains() : MMCifInfo
• GetEntityBranchLinks() : MMCifInfo
• GetEntityChain() : OMF
• GetEntityDesc() : MMCifInfo
• GetEntityHandler() : FileTypeDialog
• GetEntityID() : MMCifInfoStructRef
• GetEntityIds() : MMCifInfo
• GetEntityIdsOfType() : MMCifInfo
• GetEntityOfViews() : SceneWinModel
• GetEntityView() : EntityViewColorOp , QueryViewWrapper
• GetEntries() : IndexedVertexArray
• GetEntropy() : ProfileColumn
• GetEntryID() : MMCifInfoStructDetails
• GetEps() : ButterworthLowPassFilter
• GetEpsilon() : Topology
• GetEpsilons() : Topology
• GetErrorDescription() : QueryImpl , Query
• GetErrorLogging() : TextLogger
• GetException() : TerminiExceptions
• GetExclusions() : BuildingBlock , Topology
• GetExportAspect() : Scene
• GetExtent() : CuboidAxis , DataViewerPanelBase , ConstData , ExtentIterator , ImageHandle , ConstImageHandle , ImageStateBase , FrequencyDomain , HalfFrequencyDomain , ImageStateImpl< T, D > , SpatialDomain , NullData
• GetFar() : Scene
• GetFastHighMagnificationDrawing() : DataViewerPanelBase
• GetFastLowMagnificationDrawing() : DataViewerPanelBase
• GetFFTSize() : FFTPanel
• GetFGMDHBondAcceptorIndices() : Topology
• GetFGMDHBondAcceptorParameters() : Topology
• GetFGMDHBondAcceptors() : Topology
• GetFGMDHBondDonorIndices() : Topology
• GetFGMDHBondDonorParameters() : Topology
• GetFGMDHBondDonors() : Topology
• GetFibonacciX() : DSSPAccessibilityParam
• GetFibonacciY() : DSSPAccessibilityParam
• GetFibonacciZ() : DSSPAccessibilityParam
• GetFillColor() : Primitive
• GetFirst() : BondHandle , ConnectorImpl , Dihedral , TorsionHandle
• GetFirstAtom() : ClashEvent , StereoChemicalBondViolation , StereoChemicalAngleViolation
• GetFirstChild() : OctreeNode
• GetFirstNonGap() : SequenceImpl , ConstSequenceHandle , SequenceHandle
• GetFirstRelease() : MMCifInfoRevisions
• GetFixCenter() : Scene
• GetFixedPickRadius() : ConnectRendererBase
• GetFixElement() : RuleBasedProcessor
• GetFlags() : QueryViewWrapper
• GetFlatChainMapping() : ReprResult
• GetFlatMapping() : MappingResult
• GetFloatProp() : ConstGenericPropContainer< H >
• GetFloatProperty() : AtomBase , AtomImpl , ResidueImpl , ResidueBase
• GetFloatRepr() : EleImpl
• GetFog() : Scene
• GetFogColor() : Scene
• GetFogFarOffset() : Scene
• GetFogNearOffset() : Scene
• GetFont() : BaseRow
• GetFontSize() : BaseRow
• GetForcefield() : FFReader
• GetForces() : Simulation
• GetFormat() : IndexedVertexArray , TIF
• GetFormatDescription() : ClustalIOHandler , EntityIOCRDHandler , EntityIOHandlerFactoryBase , EntityIOMAEHandler , EntityIOMMCIFHandler , EntityIOPDBHandler , EntityIOPQRHandler , EntityIOSDFHandler , FastaIOHandler , HhmIOHandler , MapIODatHandler , DF3MapIOHandler , MapIODm3Handler , MapIODxHandler , MapIOHandlerFactoryBase , MapIOIPLHandler , MapIOJpkHandler , MapIOMrcHandler , MapIONanoscopeHandler , MapIOPngHandler , MapIOSitusHandler , MapIOSpiHandler , MapIOTiffHandler , MapIODatHandler , DF3MapIOHandler , MapIODm3Handler , MapIODxHandler , MapIOHandlerFactoryBase , MapIOIPLHandler , MapIOJpkHandler , MapIOMrcHandler , MapIONanoscopeHandler , MapIOPngHandler , MapIOSitusHandler , MapIOSpiHandler , MapIOTiffHandler , EntityIOCRDHandler , EntityIOHandlerFactoryBase , EntityIOMAEHandler , EntityIOMMCIFHandler , EntityIOPDBHandler , EntityIOPQRHandler , EntityIOSDFHandler , SurfaceIOHandlerFactoryBase , SurfaceIOMSMSHandler , PirIOHandler , ProfileIOHandlerFactoryBase , PromodIOHandler , PssmIOHandler , ClustalIOHandler , FastaIOHandler , HhmIOHandler , PirIOHandler , ProfileIOHandlerFactoryBase , PromodIOHandler , PssmIOHandler , SequenceIOHandlerFactoryBase , SurfaceIOHandlerFactoryBase , SurfaceIOMSMSHandler
• GetFormatName() : ClustalIOHandler , EntityIOCRDHandler , EntityIOHandlerFactoryBase , EntityIOMAEHandler , EntityIOMMCIFHandler , EntityIOPDBHandler , EntityIOPQRHandler , EntityIOSDFHandler , FastaIOHandler , HhmIOHandler , MapIODatHandler , DF3MapIOHandler , MapIODm3Handler , MapIODxHandler , MapIOHandlerFactoryBase , MapIOIPLHandler , MapIOJpkHandler , MapIOMrcHandler , MapIONanoscopeHandler , MapIOPngHandler , MapIOSitusHandler , MapIOSpiHandler , MapIOTiffHandler , MapIODatHandler , DF3MapIOHandler , MapIODm3Handler , MapIODxHandler , MapIOHandlerFactoryBase , MapIOIPLHandler , MapIOJpkHandler , MapIOMrcHandler , MapIONanoscopeHandler , MapIOPngHandler , MapIOSitusHandler , MapIOSpiHandler , MapIOTiffHandler , EntityIOCRDHandler , EntityIOHandlerFactoryBase , EntityIOMAEHandler , EntityIOMMCIFHandler , EntityIOPDBHandler , EntityIOPQRHandler , EntityIOSDFHandler , SurfaceIOHandlerFactoryBase , SurfaceIOMSMSHandler , PirIOHandler , ProfileIOHandlerFactoryBase , PromodIOHandler , PssmIOHandler , ClustalIOHandler , FastaIOHandler , HhmIOHandler , PirIOHandler , ProfileIOHandlerFactoryBase , PromodIOHandler , PssmIOHandler , SequenceIOHandlerFactoryBase , SurfaceIOHandlerFactoryBase , SurfaceIOMSMSHandler
• GetFormatString() : ImageFormatBase
• GetFormattedMessage() : QueryError
• GetFormula() : Compound
• GetFourth() : Dihedral , TorsionHandle
• GetFOV() : Scene
• GetFrame() : CoordGroupHandle , CoordSource , InMemCoordSource
• GetFrame2() : CoordGroupHandle
• GetFrameCount() : CoordGroupHandle , CoordSource , InMemCoordSource
• GetFrameDelta() : CoordSource
• GetFramePositions() : CoordGroupHandle
• GetFreeD() : Domains
• GetFreeS() : Domains
• GetFreq() : ProfileColumn
• GetFrequencySampling() : ConstData , PixelSampling
• GetFudgeLJ() : Forcefield , Topology
• GetFudgeQQ() : Forcefield , Topology
• GetFullName() : WidgetFactory , WidgetRegistry
• GetFullView() : EntityRenderer
• GetFuncType() : Interaction
• GetGallery() : ImageList
• GetGamma() : DataViewerPanelBase , ViewerNormalizer , Ellipse2 , Hyperbola2 , DataViewer
• GetGaplessString() : SequenceImpl , ConstSequenceHandle , SequenceHandle
• GetGBSARadii() : Topology
• GetGBSARadius() : Topology
• GetGDT() : Vec3List
• GetGDTHA() : Vec3List
• GetGDTTS() : Vec3List
• GetGeometry() : LineAverageBase
• GetGfxColor() : ColorSelectWidget
• GetGfxGradient() : GradientEdit , ImmutableGradientInfoHandler
• GetGfxNode() : GfxSceneNode , RenderModesNode
• GetGfxNodes() : SceneWinModel
• GetGfxObject() : SequenceViewObject
• GetGlobalRow() : SequenceModel
• GetGlobalScore() : lDDTScorer
• GetGLWin() : GostyApp
• GetGradient() : BasicGradientColorOp , GradientColorOp , GradientManager , GradientEdit , GradientListModel
• GetGradientNames() : GradientManager
• GetGreen() : Color
• GetGroup() : InfoGroup , InfoHandle
• GetGroups() : ToolOptions , InfoGroup
• GetGutterBlocks() : PythonShellWidget
• GetHalf() : Size
• GetHalfExtent() : CuboidAxis
• GetHalfExtents() : Cuboid
• GetHandle() : Surface , AtomHandle , AtomView , ChainHandle , ChainView , EntityHandle , EntityView , ResidueHandle , ResidueView
• GetHarmonicAngleIndices() : Topology
• GetHarmonicAngleParameters() : Topology
• GetHarmonicAngles() : Topology
• GetHarmonicBondIndices() : Topology
• GetHarmonicBondParameters() : Topology
• GetHarmonicBonds() : Topology
• GetHarmonicDistanceRestraintIndices() : Topology
• GetHarmonicDistanceRestraintParameters() : Topology
• GetHarmonicDistanceRestraints() : Topology
• GetHarmonicImproperIndices() : Topology
• GetHarmonicImproperParameters() : Topology
• GetHarmonicImpropers() : Topology
• GetHarmonicPositionRestraintIndices() : Topology
• GetHarmonicPositionRestraintParameters() : Topology
• GetHarmonicPositionRestraints() : Topology
• GetHashCode() : AtomHandle , AtomView , BondHandle , ChainHandle , ChainView , EntityHandle , ResidueHandle , ResidueView
• GetHeader() : lDDTLocalScore
• GetHeight() : Rectangle2 , Extent , RasterImage , Size
• GetHelixEcc() : CartoonRenderOptions
• GetHelixMode() : CartoonRenderOptions
• GetHelixProfileType() : CartoonRenderOptions
• GetHelixThickness() : CartoonRenderOptions
• GetHelixWidth() : CartoonRenderOptions
• GetHemiParams() : Scene
• GetHistogram() : MapIso
• GetHistogramBinCount() : MapIso
• GetHMMData() : ProfileColumn
• GetHSV() : Color
• GetHSVA() : Color
• GetHSVMode() : Gradient
• GetHue() : Color
• GetHydrogenConstructor() : Forcefield
• GetHydrogenRuleAnchors() : GromacsHydrogenConstructor
• GetHydrogenRuleMethod() : GromacsHydrogenConstructor
• GetHydrogenRuleNames() : GromacsHydrogenConstructor
• GetHydrogenRuleNumber() : GromacsHydrogenConstructor
• GetHydrogens() : Checker
• GetIcon() : MessageWidget , Manipulator , MapTool , MeasureTool , SelectionTool , Tool , GradientListModel , PresetListModel
• GetID() : Compound , MMCifInfoTransOp , MMCifInfoBioUnit , MMCifInfoCitation , MMCifInfoObsolete , MMCifInfoStructRef , MMCifInfoStructRefSeq , MMCifInfoTransOp , MMCifInfoBioUnit , MMCifInfoCitation , MMCifInfoObsolete , MMCifInfoStructRef , MMCifInfoStructRefSeq
• GetIDList() : OverlayManager
• GetIdx() : ResidueDefinition
• GetImageStack() : ImageList
• GetImpl() : ConstGenericPropContainer< H >
• GetImplementation() : Normalizer
• GetImplicitGenborn() : Forcefield
• GetImpropers() : BuildingBlock , Forcefield , GromacsBlockModifier
• GetInchi() : Compound
• GetInchiKey() : Compound
• GetIndex() : InputEvent , PanelBar , ToolOptionEnum , StarLoopDesc , StarWriterLoopDesc , StarLoopDesc , StarWriterLoopDesc , AtomBase , AtomImpl , ChainImpl , ResidueImpl , ResidueHandle , ResidueView , AlignedColumn , SequenceImpl , ProfileColumn , ConstSequenceHandle , SequenceHandle
• GetIndexesForSubject() : SequenceViewObject
• GetIndexesForView() : SequenceViewObject
• GetIndexForResNum() : ChainImpl
• GetIndexOf() : SceneWinModel
• GetInertia() : Vec3List
• GetInfo() : MMCifReader
• GetInsCode() : ResNum
• GetInsertions() : InsDel
• GetInstance() : NACCESSAccessibilityParam , DSSPAccessibilityParam
• GetInternalWidget() : Widget
• GetIntpolComplex() : ConstData , ImageHandle , ConstImageHandle , ImageStateBase , ImageStateImpl< T, D > , NullData
• GetIntpolReal() : ConstData , ImageHandle , ConstImageHandle , ImageStateBase , ImageStateImpl< T, D > , NullData
• GetIntProp() : ConstGenericPropContainer< H >
• GetIntProperty() : AtomBase , AtomImpl , ResidueImpl , ResidueBase
• GetIntRepr() : EleImpl
• GetInvert() : DataViewer , DataViewerPanelBase , ViewerNormalizer
• GetInvertedMatrix() : Transform
• GetInvertedProjection() : Scene
• GetInvTransformationMatrix() : EntityHandle
• GetISBN() : MMCifInfoCitation
• GetItem() : SceneWinModel , InfoGroup , InfoHandle
• GetItems() : InfoGroup
• GetIterator() : ImageHandle , ConstImageHandle
• GetJsonString() : MeanlDDT , VarianceMap , Dist2Mean
• GetKey() : ResidueImpl , EdgeDesc , ToolOption , ToolOptionGroup , ResidueBase
• GetKeywordIndex() : GromacsData , CHARMMData
• GetKineticEnergy() : Simulation
• GetKurtosis() : StatBase , StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE >
• GetLastDate() : MMCifInfoRevisions
• GetLastMajor() : MMCifInfoRevisions
• GetLastMinor() : MMCifInfoRevisions
• GetLastNonGap() : SequenceImpl , ConstSequenceHandle , SequenceHandle
• GetLastPos() : MouseEvent
• GetLastRow() : GradientListModel , PresetEditorListModel , PresetListModel
• GetlDDTMapping() : ChainMapper
• GetLength() : SequenceHandle , AlignedRegion , BondHandle , ConnectorImpl , ContextProfile , AlignmentHandle , SequenceImpl , ConstSequenceHandle
• GetLevel() : LevelPreview , BasicGradientColorOp , GradientLevelColorOp , MapIso
• GetLHS() : LogicOPNode
• GetLightDir() : Scene
• GetLightRot() : Scene
• GetLimit() : LowPassFilter , HighPassFilter , GaussianLowPassFilter , GaussianHighPassFilter , FermiLowPassFilter , FermiHighPassFilter , ButterworthLowPassFilter
• GetLine() : LineIterator
• GetLineHalo() : GfxObj
• GetLineIndices() : IndexedVertexArray
• GetLineWidth() : LineRenderOptions , GfxObj , Primitive , Measurement , MeasureTool
• GetList() : BackboneTrace , InfoPath
• GetListCount() : BackboneTrace
• GetListSize() : Observable
• GetLJ() : Forcefield
• GetLJPairIndex() : Topology
• GetLJPairIndices() : Topology
• GetLJPairParameters() : Topology
• GetLJPairs() : Topology
• GetLocalRot() : ConnectorImpl
• GetLocalScores() : lDDTScorer
• GetLog() : StringLogSink
• GetLogicalExtent() : ImageStateBase , FrequencyDomain , HalfFrequencyDomain , ImageStateImpl< T, D > , SpatialDomain
• GetLowerLimit() : ToolOptionNum< T, C >
• GetMainArea() : Perspective
• GetMainModule() : PythonInterpreter
• GetMainNamespace() : PythonInterpreter
• GetMajor() : MMCifInfoRevisions
• GetMap() : MapIso
• GetMapHandle() : MapHandleColorOp
• GetMapHandler() : FileTypeDialog
• GetMappedRMSD() : _CachedRMSD
• GetMapping() : ChainMapper
• GetMask() : ColorOp , MaskOverlay
• GetMass() : Forcefield , ChainImpl , ChainView , MMCifInfoStructDetails , AtomBase , ChainHandle , EntityHandle , EntityView , AtomImpl , EntityImpl , ResidueImpl , BuildingBlock , Topology , ResidueHandle , ResidueView
• GetMasses() : BuildingBlock , Topology
• GetMassMethod() : MMCifInfoStructDetails
• GetMaster() : AlignedRegion
• GetMatchingBackboneViews() : AlignmentHandle
• GetMaterial() : GfxObj
• GetMatrix() : MMCifInfoTransOp , Transform , MMCifInfoTransOp
• GetMax() : Distances , AlignedCuboid , OctreeNode
• GetMaxAdjustedDistance() : ClashingDistances
• GetMaxColumnCount() : BaseViewObject
• GetMaxError() : OMF
• GetMaximum() : DAT , DF3 , RangeHandler , StatBase , StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE > , StatMinMaxBase , ImageFormatBase , DAT , IPL , PNG , TIF , DF3 , IPL , PNG , TIF
• GetMaximumPosition() : StatBase , StatMinMaxBase
• GetMaxLength() : ConstSequenceList , SequenceListImpl , SequenceList
• GetMaxLevel() : MapIso
• GetMaxPos() : QSEntity
• GetMaxRad() : CartoonRenderOptions , TraceRenderOptions
• GetMaxV() : GradientColorOp
• GetMaxWeight() : SubstWeightMatrix
• GetMean() : MapIso , StatBase , StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE >
• GetMeasurement() : Measurement
• GetMeasureMode() : MeasureTool
• GetMembraneAxis() : FindMemParam
• GetMenu() : Perspective , NullOverlay , DrawOverlay , MaskOverlay , Overlay , PointlistOverlayBase , PanelManager
• GetMenuBar() : Perspective
• GetMessage() : QueryError
• GetMessageCount() : MessageLevel
• GetMessagesCount() : MessageWidget
• GetMessageWidget() : GostyApp
• GetMethod() : MMCifInfo
• GetMethodDetails() : MMCifInfoBioUnit
• GetMin() : Distances , AlignedCuboid , OctreeNode
• GetMinDist() : Vec3List
• GetMinDistance() : CoordFrame
• GetMinDistBetwCenterOfMassAndView() : CoordFrame
• GetMinimum() : PNG , TIF , StatMinMaxBase , StatBase , StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE > , RangeHandler , ImageFormatBase , DAT , DF3 , IPL , PNG , DAT , DF3 , IPL , TIF
• GetMinimumPosition() : StatBase , StatMinMaxBase
• GetMinLength() : SequenceListImpl , ConstSequenceList , SequenceList
• GetMinLevel() : MapIso
• GetMinMax() : EntityView
• GetMinor() : MMCifInfoRevisions
• GetMinPos() : QSEntity
• GetMinV() : GradientColorOp
• GetMinWeight() : SubstWeightMatrix
• GetMMCifEntityIdTr() : MMCifInfo
• GetMMCifPDBChainTr() : MMCifInfo
• GetMode() : CustomRenderer , DebugRenderer , EditorBase , IndexedVertexArray
• GetModel() : SceneWin
• GetModelDetails() : MMCifInfoStructDetails
• GetModelDistance() : ClashEvent
• GetModelIndexes() : SequenceModel
• GetModelTypeDetails() : MMCifInfoStructDetails
• GetModificationDate() : Compound
• GetMoment() : StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE >
• GetMousePosition() : DataViewerPanelBase
• GetN() : StarWriterLoop
• GetName() : Compound , GfxNode , EntityRenderer , Overlay , PanelWidgetContainer , SplitterPanelBar , TabbedPanelBar , EntityPartNode , SequenceRow , Measurement , Tool , AndOp , OrOp , XorOp , InfoGroup , InfoHandle , EleImpl , InfoItem , InfoSet , OMF , StarDataItem , AtomBase , ChainBase , AtomImpl , ChainImpl , EntityImpl , TorsionImpl , Prop , ResidueBase , TorsionHandle , SequenceImpl , ConstSequenceHandle , SequenceHandle , RenderOp , VisibilityOp , QSscoreEntity , Table , EntityBase , Preset , ResidueImpl , OpBase , OMF , AlgorithmBase , LabelNode , ColorOp
• GetNames() : Interaction , ProfileDB
• GetNChainContacts() : lDDTScorer
• GetNChiAngles() : ResidueDefinition
• GetNear() : Scene
• GetNeff() : HMMData , ProfileHandle
• GetNeff_D() : HMMData
• GetNeff_I() : HMMData
• GetNext() : ChainHandle , ResidueHandle , ChainImpl
• GetNextLine() : LineIterator
• GetNMappings() : ChainMapper
• GetNode() : Polygon2
• GetNodeCount() : Polygon2 , Scene
• GetNormal() : Plane , IndexedVertexArray
• GetNormalizeOnSave() : DAT , DF3 , DX , IPL , MRC , PNG , Situs , Spider , TIF , DAT , DF3 , IPL , MRC , PNG , Spider , TIF , DX , Situs
• GetNormalizer() : DataViewer , DataViewerPanelBase
• GetNormalSmoothFactor() : GfxObj , CartoonRenderOptions , TraceRenderOptions
• GetNormStdDev() : Distances
• GetNotEmptyRenderModes() : Entity
• GetNTerModifier() : Forcefield
• GetNullModel() : ProfileHandle
• GetNum() : MMCifInfoRevisions , ResNum , MMCifInfoRevisions
• GetNumAddRules() : GromacsBlockModifier
• GetNumber() : ResidueBase , ResidueImpl
• GetNumCMaps() : Topology
• GetNumConservedContacts() : lDDTScorer
• GetNumDistanceConstraints() : Topology
• GetNumElements() : LinearCharacterContainer , LinearPositionContainer
• GetNumExclusions() : Topology
• GetNumFGMDHBondAcceptors() : Topology
• GetNumFGMDHBondDonors() : Topology
• GetNumFreeResidues() : Domains
• GetNumHarmonicAngles() : Topology
• GetNumHarmonicBonds() : Topology
• GetNumHarmonicDistanceRestraints() : Topology
• GetNumHarmonicImpropers() : Topology
• GetNumHarmonicPositionRestraints() : Topology
• GetNumHydrogenRules() : GromacsHydrogenConstructor
• GetNumLJPairs() : Topology
• GetNumNodesForLevel() : MapOctree
• GetNumParticles() : Topology
• GetNumPeriodicDihedrals() : Topology
• GetNumPeriodicImpropers() : Topology
• GetNumPositionConstraints() : Topology
• GetNumpyMatrix() : Table
• GetNumpyMatrixAsArray() : Table
• GetNumReplaceRules() : GromacsBlockModifier
• GetNumResidues() : LinearIndexer , Dist2Mean , MeanlDDT
• GetNumSamples() : StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE >
• GetNumStructures() : DistanceMap , Dist2Mean , MeanlDDT
• GetNumTotalContacts() : lDDTScorer
• GetNumUreyBradleyAngles() : Topology
• GetOBCScaling() : Topology
• GetOBCScalings() : Topology
• GetObservedData() : DataObserver
• GetObsolete() : Compound
• GetObsoleteInfo() : MMCifInfo
• GetOccupancy() : AtomBase , AtomImpl
• GetODRLine() : Vec3List , CoordFrame
• GetODRPlane() : Vec3List , CoordFrame
• GetOffset() : DataViewer , DataViewerPanelBase , SequenceImpl , ConstSequenceHandle , SequenceHandle
• GetOligoLDDTScorer() : QSscorer
• GetOmegaTorsion() : ResidueImpl , ResidueBase
• GetOneLetterCode() : Compound , ResidueImpl , ResidueBase , SequenceImpl , ConstSequenceHandle , SequenceHandle , AlignmentHandle
• GetOp() : Preset , PresetEditorListModel , UniformColorOpWidget , GradientLevelColorOpWidget , ByElementColorOpWidget , ByChainColorOpWidget , RenderOpWidget , VisibilityOpWidget
• GetOP() : LogicOPNode
• GetOpacity() : Entity , GfxObj , GfxObjBase
• GetOpCount() : Preset
• GetOperations() : MMCifInfoBioUnit , MMCifInfo , MMCifInfoBioUnit , MMCifInfo
• GetOperationsIntervalList() : MMCifInfoBioUnit
• GetOperatorName() : CompositeMask
• GetOps() : Preset
• GetOptimalPrefactors() : Table
• GetOption() : ToolOptions
• GetOptions() : DebugRenderer , LineTraceRenderer , CPKRenderer , CustomRenderer , Entity , CartoonRenderer , EntityRenderer , TraceRenderer , ToolOptionGroup , RenderModeWidget , SimpleRenderer , SlineRenderer
• GetOrCreateRenderer() : Entity
• GetOrGenVert() : OctreeIsocont
• GetOrigin() : Rotation3 , Plane , Ellipse2 , Line2 , Line3 , Sphere , Hyperbola2
• GetOriginalMap() : MapIso
• GetOriginalPos() : AtomBase , Dihedral , TorsionHandle , BondHandle , ConnectorImpl
• GetOSTVersionUsed() : CompoundLib
• GetOther() : BondHandle
• GetOutline() : GfxObjBase , GfxObj
• GetOutlineColor() : Primitive
• GetOutlineExpandColor() : IndexedVertexArray , GfxObjBase , GfxObj
• GetOutlineExpandFactor() : GfxObjBase , GfxObj , IndexedVertexArray
• GetOutlineMode() : GfxObj , GfxObjBase , IndexedVertexArray
• GetOutlineWidth() : GfxObj , GfxObjBase , IndexedVertexArray
• GetOutputLogging() : TextLogger
• GetOverlayId() : OverlayManager
• GetOverlayManager() : DataViewer
• GetOverlayName() : OverlayManager
• GetP() : Plane
• GetPageFirst() : MMCifInfoCitation
• GetPageLast() : MMCifInfoCitation
• GetPainter() : BaseRow
• GetPainterCount() : BaseRow
• GetPainters() : BaseRow , SequenceModel
• GetPairScore() : AAIndexData
• GetPanelBar() : PanelWidgetContainer
• GetPanels() : Perspective
• GetParam() : Interaction , StereoChemicalParams
• GetParent() : InfoItem , InfoHandle , GfxNode , InfoGroup , EleImpl , Node , PythonContext , SceneNode
• GetParm() : SelNode
• GetPath() : CalculateSurfaceSettingsDialog , InfoGroup , EleImpl
• GetPDBID() : MMCifInfoObsolete
• GetPDBMMCifChainTr() : MMCifInfo
• GetPeakList() : HighestPeakSearch3DBase
• GetPen() : SymbolDrawingStrategy
• GetPenColor() : SymbolDrawingStrategy
• GetPeriodicBoxExtents() : Simulation
• GetPeriodicDihedralIndices() : Topology
• GetPeriodicDihedralParameters() : Topology
• GetPeriodicDihedrals() : Topology
• GetPeriodicImproperIndices() : Topology
• GetPeriodicImproperParameters() : Topology
• GetPeriodicImpropers() : Topology
• GetPerResidueScores() : MappedLDDTScorer
• GetPerspective() : GostyApp
• GetPhasecolor() : TIF
• GetPhi() : Rotation3
• GetPhiTorsion() : ResidueImpl , ResidueBase
• GetPhysicalExtent() : HalfFrequencyDomain , SpatialDomain , FrequencyDomain
• GetPixel() : RasterImage
• GetPixelSampling() : PixelSampling , ConstData , DataViewerPanelBase
• GetPlane() : MapSlab
• GetPointCloud() : PointCloudManager
• GetPoints() : PointCloud
• GetPointWeight() : DSSPAccessibilityParam
• GetPolyMode() : CartoonRenderOptions
• GetPos() : ConnectorImpl , SequenceHandle , MyGradientStop , TorsionHandle , SequenceImpl , ConstSequenceHandle , AtomBase , BondHandle , MouseEvent , Dihedral , AlignmentHandle , SequenceListImpl , QSEntity
• GetPosition() : LinearPositionContainer
• GetPositionConstraints() : Topology
• GetPositions() : LinearPositionContainer , Simulation , OMF
• GetPotentialEnergy() : Simulation
• GetPreset() : PresetListModel , ImmutablePresetInfoHandler
• GetPresets() : ImmutablePresetInfoHandler
• GetPrev() : ChainHandle , ResidueHandle , ChainImpl
• GetPrimaryConnector() : AtomImpl
• GetPrincipalAxes() : Vec3List
• GetProb() : HMMData
• GetProfile() : ProfileDB
• GetProgress() : Progress
• GetProjection() : Scene
• GetPropAsString() : ConstGenericPropContainer< H >
• GetProperty() : GradientColorOp
• GetPropList() : ConstGenericPropContainer< H > , GenericPropContainerImpl
• GetPropMap() : GenericPropContainerImpl , ConstGenericPropContainer< H >
• GetPseudoCount() : ContextProfile
• GetPseudoCounts() : ContextProfile
• GetPsi() : Rotation3
• GetPsiTorsion() : ResidueBase , ResidueImpl
• GetPublishedIn() : MMCifInfoCitation
• GetPubMed() : MMCifInfoCitation
• GetPyShell() : GostyApp
• GetQGradient() : ImmutableGradientInfoHandler
• GetQGradients() : ImmutableGradientInfoHandler
• GetQSScoreMapping() : ChainMapper
• GetQuadIndices() : IndexedVertexArray
• GetQualifiedAtomName() : UniqueAtomIdentifier
• GetQualifiedName() : ResidueImpl , AtomBase , AtomImpl , ResidueBase
• GetQuat() : Rotation3
• GetQuery() : QueryViewWrapper , QueryEditorWidget
• GetQueryFlags() : QueryEditorWidget
• GetQueryString() : QueryError , QueryImpl , Query
• GetQueryText() : QueryEditorWidget
• GetQueryView() : EntityPartNode , Entity , CurrentSelectionNode
• GetQueryViewsList() : SceneWinModel
• GetRadius() : Circle2 , PointCloud , AtomImpl , Sphere , AtomBase
• GetRadiusMult() : CPKRenderOptions
• GetRadiusSquare() : WithinParam
• GetRange() : QueryError , PythonContext , PythonToken , QueryToken
• GetReadSeqRes() : PDBReader , MMCifReader
• GetReal() : ImageStateBase , ImageStateImpl< T, D > , SpatialDomain , HalfFrequencyDomain , ImageHandle , ConstData , ConstImageHandle , FrequencyDomain , NullData
• GetReceiver() : ToolOptionButton
• GetRed() : Color
• GetRef() : WithinParam
• GetReferences() : lDDTScorer
• GetRel() : MyGradientStop , Gradient::Stop
• GetRenderMode() : SlineRenderOptions , TraceWidget , WireframeWidget , SimpleWidget , CustomRenderOptions , LineTraceWidget , RenderModeWidget , RenderOp , CustomWidget , RenderOptions , SimpleRenderOptions , CartoonRenderOptions , GfxObj , GfxObjBase , CPKRenderOptions , LineTraceRenderOptions , TraceRenderOptions , RenderModeNode , CPKWidget , HSCWidget , EmptyMode , SlineWidget , TubeWidget
• GetRenderModeName() : Entity
• GetRenderView() : Entity
• GetReplacedBy() : Compound
• GetReplacedPDBID() : MMCifInfoObsolete
• GetReplaceRuleName() : GromacsBlockModifier
• GetReplaceRuleNewCharge() : GromacsBlockModifier
• GetReplaceRuleNewName() : GromacsBlockModifier
• GetReplaceRuleNewType() : GromacsBlockModifier
• GetRepr() : ChainMapper
• GetResidue() : AtomHandle , AtomImpl , AlignmentHandle , SequenceImpl , ConstSequenceHandle , Diag , AtomView , AlignedColumn , SequenceHandle
• GetResidueAccessibility() : DSSPAccessibilityParam , NACCESSAccessibilityParam
• GetResidueByIndex() : ChainHandle , ChainView
• GetResidueCount() : ChainImpl , ChainHandle , ChainView , EntityHandle , EntityView , EntityImpl
• GetResidueIndex() : ChainView , AlignmentHandle , SequenceImpl , SequenceListImpl , AlignedColumn , ConstSequenceHandle , SequenceHandle
• GetResidueList() : ChainImpl , ChainView , ChainHandle , EntityHandle , ChainImpl , EntityView
• GetResidueName() : UniqueAtomIdentifier
• GetResidueRenamingCTer() : Forcefield
• GetResidueRenamingMain() : Forcefield
• GetResidueRenamingNTer() : Forcefield
• GetResidueRenamingTwoTer() : Forcefield
• GetResNum() : UniqueAtomIdentifier
• GetResolution() : MMCifInfo
• GetRestrictChains() : MMCifReader
• GetRevisions() : MMCifInfo
• GetRFree() : MMCifInfo
• GetRGB() : Color
• GetRGBA() : Color
• GetRHS() : LogicOPNode
• GetRigidMapping() : ChainMapper
• GetRingAtomCount() : RingFinder
• GetRingBondCount() : RingFinder
• GetRings() : RingFinder
• GetRMSD() : TMAlignResult , MMAlignResult , Vec3List , CoordFrame
• GetRole() : ConstSequenceHandle , SequenceImpl , SequenceHandle
• GetRoot() : EleImpl
• GetRootMeanSquare() : StatBase , StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE >
• GetRootNode() : Scene
• GetRot() : Transform
• GetRotamericAtoms() : ResidueDefinition
• GetRotationAngle() : Rotation3
• GetRotationAxis() : Rotation3
• GetRotationMatrix() : Rotation3
• GetRow() : BaseViewObject , Mat3 , SceneNode
• GetRowCount() : AlignedColumn , BaseViewObject
• GetRTC() : Scene
• GetRWork() : MMCifInfo
• GetSampling() : ImageStateImpl< T, D > , ImageStateBase
• GetSat() : Color
• GetScale() : Exporter
• GetSceneWin() : GostyApp
• GetScore() : ProfileColumn , AAIndexData , ContactPredictionScoreResult
• GetSecond() : TorsionHandle , ConnectorImpl , Dihedral , BondHandle
• GetSecondaryConnectors() : AtomImpl
• GetSecondAtom() : ClashEvent , StereoChemicalAngleViolation , StereoChemicalBondViolation
• GetSecStructure() : ResidueBase , ResidueImpl
• GetSelectedPath() : TerminalUsageDialog
• GetSelection() : RenderOp , Entity , ColorOp , VisibilityOp , DataViewer , DataViewerPanelBase
• GetSelectionColor() : EntityRenderer
• GetSelectionColorOutline() : EntityRenderer
• GetSelectionFlags() : RenderOp , ColorOp , VisibilityOp
• GetSelectionMode() : DataViewerPanelBase , SelectionTool , Scene
• GetSeqBegin() : MMCifInfoStructRefSeq
• GetSeqEnd() : MMCifInfoStructRefSeq
• GetSeqHack() : Entity , BackboneTrace
• GetSeqRes() : MMCifReader , PDBReader , MMCifReader , PDBReader
• GetSeqRNum() : MMCifInfoStructRefSeqDif
• GetSequence() : QSEntity , ProfileHandle , ContactEntity , SequenceRow , SequenceListImpl , AlignmentHandle , OMF
• GetSequenceHandler() : FileTypeDialog
• GetSequenceOffset() : AlignmentHandle
• GetSequenceRole() : AlignmentHandle
• GetSequences() : AlignmentHandle
• GetSequenceViewer() : GostyApp
• GetSequentialAtoms() : PQRReader , CRDReader , PQRReader , CRDReader
• GetShadow() : Scene
• GetShadowQuality() : Scene
• GetShadowWeight() : Scene
• GetShape() : CircleDrawingStrategy , CrosshairCircleDrawingStrategy , SquareDrawingStrategy , SymbolDrawingStrategy , CrosshairSquareDrawingStrategy
• GetShift() : MaskOverlay , FractionalShift
• GetShowAction() : PanelBar
• GetShowCenter() : Scene
• GetShowExportAspect() : Scene
• GetShownMapType() : MapIso
• GetShowScores() : SelectRefDialog
• GetSidechainAtomRules() : ResidueDefinition
• GetSigma() : Topology
• GetSigmas() : Topology
• GetSigned() : DAT , TIF
• GetSiteLoaderIdents() : FileLoader
• GetSize() : LineIterator , StarLoopDesc , DistanceMap , ImageStateImpl< T, D > , StarLoopDesc , TriMatrix< T > , AlignedCuboid , ConstData , StarWriterLoopDesc , MMCifInfoRevisions , StarWriterLoopDesc , Extent
• GetSkewness() : StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE > , StatBase
• GetSlab() : DataViewer , Size , DataViewerPanelBase
• GetSlotMethod() : ToolOptionButton
• GetSMILES() : Compound
• GetSolid() : GfxObjBase , GfxObj , IndexedVertexArray
• GetSolidColor() : GfxObj , GfxObjBase
• GetSolidcolor() : IndexedVertexArray
• GetSpatialOrigin() : ImageStateImpl< T, D > , HalfFrequencyDomain , SpatialDomain , NullData , ConstData , ImageStateBase , ConstImageHandle , ImageHandle , FrequencyDomain
• GetSpatialSampling() : PixelSampling , ConstData
• GetSphereDetail() : CustomRenderOptions , PrimList , CPKRenderOptions
• GetSphereMode() : CPKRenderOptions
• GetSphereRad() : CustomRenderOptions
• GetSplineDetail() : SlineRenderOptions , CartoonRenderOptions
• GetStandardDeviation() : StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE > , StatBase
• GetStart() : Extent , AlignedRegion , ExtentIterator , Rectangle2
• GetStartTime() : CoordSource , CoordGroupHandle
• GetState() : AtomImpl
• GetStaticColumn() : SequenceTableView
• GetStaticField() : SequenceTableView
• GetStaticRow() : SequenceTableView
• GetStatus() : MMCifInfoRevisions
• GetStdDev() : MapIso , Distances
• GetStereoAlg() : Scene
• GetStereoDistance() : Scene
• GetStereoFlip() : Scene
• GetStereoIOD() : Scene
• GetStereoMode() : Scene
• GetStereoView() : Scene
• GetStop() : ButterworthLowPassFilter
• GetStops() : Gradient
• GetStrandEcc() : CartoonRenderOptions
• GetStrandMode() : CartoonRenderOptions
• GetStrandProfileType() : CartoonRenderOptions
• GetStrandThickness() : CartoonRenderOptions
• GetStrandWidth() : CartoonRenderOptions
• GetStrictHydrogens() : RuleBasedProcessor
• GetString() : SequenceHandle , SequenceImpl , ConstSequenceHandle
• GetStringProp() : ConstGenericPropContainer< H >
• GetStringProperty() : AtomImpl , ResidueBase , ResidueImpl , AtomBase
• GetStringRepr() : EleImpl
• GetStructDetails() : MMCifInfo
• GetStructRefs() : MMCifInfo , MMCifReader
• GetSub() : EleImpl
• GetSubContexts() : PythonContext
• GetSubformat() : MRC
• GetSubimage() : Nanoscope , TIF
• GetSubList() : EleImpl
• GetSubs() : EleImpl
• GetSum() : StatBase , StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE >
• GetSummedSquaredDistances() : Vec3List
• GetSuperposition() : _CachedRMSD
• GetSurfaceHandler() : FileTypeDialog
• GetSymbolShape() : PointlistOverlayBase
• GetSymbolSize() : SymbolDrawingStrategy , PointlistOverlayBase
• GetSymbolStrength() : SymbolDrawingStrategy
• GetT() : FermiLowPassFilter , FermiHighPassFilter
• GetTabWidth() : PythonShellWidget
• GetTarget() : InputEvent
• GetTexCoord() : IndexedVertexArray
• GetText() : SimpleWidget , SlineWidget , TraceWidget , RenderModeWidget , ByEntityWidget , ByChainWidget , CPKWidget , ColorOptionsWidget , EmptyMode , LineTraceWidget , WireframeWidget , TubeWidget , HSCWidget , RenderOptionsWidget , GradientPresetWidget , PresetWidget , ByElementWidget , CustomWidget , UniformColorWidget
• GetTextData() : EleImpl , InfoGroup , InfoHandle
• GetTF() : GfxObj
• GetTheta() : Rotation3
• GetThird() : TorsionHandle , Dihedral
• GetThirdAtom() : StereoChemicalAngleViolation
• GetTitle() : MMCifInfoCitation , MMCifInfoStructDetails
• GetTMat() : FragmentImpl
• GetTMScore() : TMAlignResult , MMAlignResult
• GetTMScoreSwapped() : MMAlignResult , TMAlignResult
• GetToolOptions() : Tool
• GetToolOptionsWin() : GostyApp
• GetTools() : ToolManager
• GetToOrigin() : Exporter
• GetTopology() : Simulation
• GetTorsionList() : ResidueHandle , ResidueImpl
• GetTorsionMap() : EntityImpl
• GetTotalMessagesCount() : MessageWidget
• GetTraj() : TrajObserver
• GetTrans() : Transform
• GetTransform() : EntityImpl , EntityHandle , GDTResult , TMAlignResult , MMAlignResult , Scene
• GetTransformationMatrix() : EntityHandle
• GetTransformations() : BUInfo
• GetTransposedMatrix() : Transform
• GetTransProb() : ProfileColumn
• GetTri() : SurfaceHandle
• GetTriIDList() : SurfaceHandle , SurfaceImpl
• GetTriIndices() : IndexedVertexArray
• GetTubeProfileType() : CartoonRenderOptions
• GetTubeRadius() : CartoonRenderOptions , TraceRenderOptions
• GetTubeRatio() : CartoonRenderOptions
• GetTwistHack() : BackboneTrace , CartoonRenderOptions
• GetType() : ToolOption , Diag , GfxNode , ImageHandle , Measurement , ImageStateBase , ImageStateImpl< T, D > , MMCifInfoTransOp , PythonToken , ConstImageHandle , QueryToken , ChainImpl , BuildingBlock , MMCifInfoTransOp , ChainBase , InfoItem , EleImpl , GfxObj , ConstData , NullData
• GetTypeAsString() : PythonToken
• GetTypeName() : Prop
• GetTypes() : BuildingBlock , Interaction
• GetUnique() : Table
• GetUniqueID() : Widget , WidgetFactory
• GetUnkAtomTreatment() : RuleBasedProcessor
• GetUnkResidueTreatment() : RuleBasedProcessor
• GetUpperLimit() : ToolOptionNum< T, C >
• GetUreyBradleyAngleIndices() : Topology
• GetUreyBradleyAngleParameters() : Topology
• GetUreyBradleyAngles() : Topology
• GetVA() : GfxObj
• GetVal() : Color
• GetValue() : StarWriterDataItem , PythonToken , StarWriterDataItem , StarWriterValue , ToolOptionNum< T, C > , ToolOptionEnum , StarDataItem , InfoItem , Peak , StarDataItem
• GetValueRange() : QueryToken
• GetVariance() : StatBase , StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE >
• GetVdWRadius() : NACCESSAccessibilityParam , DSSPAccessibilityParam
• GetVec3Prop() : ConstGenericPropContainer< H >
• GetVecA() : Cuboid
• GetVecB() : Cuboid
• GetVecC() : Cuboid
• GetVecRepr() : EleImpl
• GetVector() : MMCifInfoTransOp , CuboidAxis
• GetVelocities() : Simulation
• GetVerboseName() : ToolOption , ToolOptionGroup
• GetVerbosityLevel() : Logger
• GetVersion() : OMF
• GetVert() : IndexedVertexArray
• GetVertex() : SurfaceHandle
• GetVertexCount() : IndexedVertexArray
• GetVertexIDList() : SurfaceImpl , SurfaceHandle
• GetView() : ColorOp , Entity
• GetViewEntity() : SceneSelection
• GetViewerMax() : DataViewerPanelBase , DataViewer
• GetViewerMin() : DataViewer , DataViewerPanelBase
• GetViewModeMenu() : PanelBar
• GetViewport() : Scene
• GetViewUnion() : SceneSelection
• GetVisible() : EntityPartNode
• GetVol() : Size
• GetVolume() : MMCifInfoCitation , Extent , AlignedCuboid , Size , MMCifInfoCitation
• GetW() : Vec4
• GetWeight() : StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE > , SubstWeightMatrix , ContextProfile
• GetWeightedStdDev() : Distances
• GetWeights() : ContextProfile
• GetWidget() : GostyApp , PanelBarWidgetHolder , WidgetGeomHandler , EventButton
• GetWidth() : Extent , Rectangle2 , FormattedLine , Size , RasterImage
• GetWriteMultiModel() : PDBWriter
• GetX() : Vec2 , Vec4 , Vec3
• GetXAxisRotation() : Transform
• GetY() : Vec4 , Vec2 , Vec3
• GetYAxisRotation() : Transform
• GetYear() : MMCifInfoCitation
• GetZ() : Vec4 , Vec3
• GetZAxisRotation() : Transform
• GetZeroOccTreatment() : Processor
• GetZeroOccupancy() : Checker
• GetZoomScale() : DataViewerPanelBase , DataViewer
• gfx : ChainComboBox
• gfx_one : SuperpositionDialog
• gfx_select_one : SuperpositionDialog
• gfx_select_two : SuperpositionDialog
• gfx_two : SuperpositionDialog
• GfxNode : Scene , GfxNode
• GfxObj() : GfxObj , Scene
• GfxObjBase() : GfxObjBase
• GfxSceneNode() : GfxSceneNode
• GfxTestObj() : GfxTestObj
• Give() : WidgetPool
• GLCanvas() : GLCanvas
• GLCleanup() : GfxObj
• glcow_ : PresetEditor
• glob_dist_list : lDDTScorer
• global_chain_mapping : LigandScorer
• global_downsampling_flag : MapIso
• global_score() : QSscorer
• globalAA : CADResult
• GLWin() : GLWin
• Gly() : Builder
• golist_ : TrajWidget
• GostExporter() : GostExporter
• GostyMainWindow() : GostyMainWindow
• gp_get() : ConstGenericPropContainer< H >
• GpImpl() : EntityBase , AtomBase , ChainBase , BondHandle , EntityBase , BondHandle , SequenceHandle , ResidueBase , SequenceHandle , ConstSequenceHandle , ChainBase , AtomBase , ConstSequenceHandle , ResidueBase
• Gradient() : Gradient
• gradient_ : ByEntityWidget , GradientPreview , GradientLevelGetCol , EntityViewGetCol , MapHandleGetCol , GradientEdit
• gradient_edit_ : GradientPresetWidget , GradientEditor , GradientLevelColorOpWidget
• GRADIENT_GROUP_NAME : ImmutableGradientInfoHandler
• gradient_preset_ : GradientEditor
• gradient_preview_ : GradientEditor , GradientLevelColorOpWidget , GradientEdit
• gradientChanged : MyGradientStop
• GradientColorOp() : GradientColorOp
• GradientFromInfo() : Gradient
• GradientLevelColorOp() : GradientLevelColorOp
• GradientLevelGetCol() : GradientLevelGetCol
• gradients_ : ImmutableGradientInfoHandler
• GRADIENTS_GROUP_NAME : ImmutableGradientInfoHandler
• gradientSelected : GradientPresetWidget
• GradientToInfo() : Gradient
• gradientUpdated : GradientEdit , MyGradientStop
• Green() : Color
• GREY : RasterImage
• grid_layout_ : ComboOptionsWidget
• gridLayout : ToolBarOptionsWidget
• GromacsBlockModifier() : GromacsBlockModifier
• GromacsHydrogenConstructor() : GromacsHydrogenConstructor
• GROUP : Exporter
• GROUPING : PythonToken
• guard_ : TransitionBase
• Gutter() : Gutter
• gutter_ : PythonShellWidget
• GUTTER_WIDTH : Gutter
• GutterBlock() : GutterBlock