Here is a list of all struct and union fields with links to the structures/unions they belong to:

- s -

• s : Units
• Saccharide : ChemClass
• SACCHARIDE : ChemClass
• SACCHARIDES : ChemType
• Sampling() : ImageHandle , ConstImageHandle , ConstData , ConstImageHandle , NullData , ConstData , NullData , ImageHandle
• Save() : SimilarityMatrix , Forcefield , Simulation , Topology , ProfileDB , Table , LinearCharacterContainer , LinearPositionContainer , LinearIndexer
• sc_lddt() : OligoLDDTScorer
• sc_lddt_scorers() : OligoLDDTScorer
• Scalar() : Scalar
• Scale() : SphericalMask , Scale , CircleMask , CompositeMask , ExtentMask , InvertedMask , MaskBase , PolygonMask
• score : AlignedPatch , HHblitsHit
• SCRIPT : Logger
• SDFReader() : SDFReader
• SDFWriter() : SDFWriter
• Search() : HHblits
• SearchColNames() : Table
• searched_hmms : HHblitsHeader
• SecStructure() : SecStructure
• SecStructureSegment() : SecStructureSegment
• sel_id : SelStmt
• sel_stacks_ : QueryImpl
• sel_values_ : QueryImpl
• Select() : EntityHandle , EntityView , EntityImpl , ResidueHandle , ResidueView , Table , ChainHandle , ChainView , EntityHandle
• SelNode() : SelNode
• SelStmt() : SelStmt
• seqid : AlignedPatch
• sequence_separation : lDDTSettings
• SequenceHandle() : SequenceHandle
• SequenceImpl() : SequenceImpl
• SequenceList : ConstSequenceHandle , SequenceHandle , ConstSequenceList , SequenceList
• SequenceListImpl() : SequenceListImpl
• SequenceListIterator() : SequenceListIterator< T, I >
• sequences : cluster
• SequencesHaveEqualLength() : SequenceListImpl , ConstSequenceList , SequenceList
• Serialize() : AminoAcidSet , PagedArray< T, P > , FixedString< LENGTH > , BuildingBlock , ResidueNames , GromacsHydrogenConstructor , GromacsBlockModifier , HeuristicHydrogenConstructor , HeuristicBlockModifier , Index< 1 > , Index< 2 > , Index< 3 > , Index< 4 > , Index< 5 > , Index< 6 > , Index< 7 > , Interaction , Topology
• SerializeHelper() : SerializeHelper< false, T > , SerializeHelper< true, T >
• SerializeWriteHelper() : SerializeWriteHelper< false, T > , SerializeWriteHelper< true, T >
• Set() : ImageHandle , IOProfileRegistry , Dist2Mean , TriMatrix< T >
• set() : AdjacencyBitmap
• SetA() : Ellipse2 , Hyperbola2 , ButterworthLowPassFilter
• SetAbsoluteOrigin() : ImageStateBase , ImageStateImpl< T, D > , ImageHandle
• SetAngle() : ICSEditor , EntityImpl , TorsionImpl
• SetAngleICS() : Dihedral
• SetAnisou() : AtomBase , AtomImpl
• SetAssignTorsions() : Processor
• SetAtom() : FragmentImpl
• SetAtomOriginalPos() : XCSEditor
• SetAtomPos() : CoordGroupHandle , CoordSource , XCSEditor
• SetAtomTransformedPos() : XCSEditor
• SetAuthChainID() : MMCifReader
• SetAuthorList() : MMCifInfoCitation
• SetB() : Ellipse2 , Hyperbola2
• SetBFactor() : AtomBase , AtomImpl
• SetBitDepth() : DAT , IPL , MRC , TIF , DAT , IPL , MRC , TIF
• SetBlocksize() : DiscreteShrinkFnc
• SetBondLength() : ICSEditor
• SetBondOrder() : BondHandle , ConnectorImpl
• SetBookPublisher() : MMCifInfoCitation
• SetBookPublisherCity() : MMCifInfoCitation
• SetBoolProp() : GenericPropContainer< H >
• SetCAS() : MMCifInfoCitation
• SetCASPFlag() : MMCifInfoStructDetails
• SetCategory() : StarLoopDesc
• SetCellAngles() : CoordFrame
• SetCellSize() : CoordFrame
• SetCenter() : Circle2 , Transform
• SetCentralAtom() : ResidueImpl , ResidueBase
• SetChainDescription() : EditorBase
• SetChainList() : MMCifInfoBioUnit
• SetChainType() : EditorBase
• SetCharge() : AtomBase , AtomImpl , Topology
• SetCharges() : Topology
• SetCheckBondFeasibility() : Processor
• SetCheckedValue() : ImageStateImpl< T, D >
• SetChemClass() : Compound , ResidueImpl , ResidueBase
• SetChemLibInfo() : CompoundLib
• SetChemType() : Compound , ResidueImpl , ResidueBase
• SetCitationType() : MMCifInfoCitation
• SetCitationTypeBook() : MMCifInfoCitation
• SetCitationTypeJournal() : MMCifInfoCitation
• SetCitationTypeUnknown() : MMCifInfoCitation
• SetClashingDistance() : ClashingDistances
• SetCMapParameters() : Topology
• SetComplex() : ImageHandle , ImageStateBase , FrequencyDomain , HalfFrequencyDomain , ImageStateImpl< T, D > , SpatialDomain
• SetCompoundLib() : ChemdictParser
• SetConnect() : Processor
• SetConnectAminoAcids() : Processor
• SetCreationDate() : Compound
• SetDate() : MMCifInfoObsolete
• SetDateOriginal() : MMCifInfoRevisions
• SetDefaultLib() : Conopology
• SetDefaultQueryFlags() : EntityHandle , EntityImpl
• SetDefinition() : MMPreprocessor
• SetDelta() : CoordGroupHandle
• SetDensity() : Topology
• SetDescription() : ChainImpl
• SetDescriptor() : MMCifInfoStructDetails
• SetDetails() : MMCifInfoBioUnit
• SetDialect() : Compound
• SetDir() : ConnectorImpl
• SetDirAndLength() : ConnectorImpl
• SetDistanceConstraintParameters() : Topology
• SetDOI() : MMCifInfoCitation
• SetDomain() : PixelSampling
• SetElement() : AtomBase , AtomImpl
• SetEnd() : Rectangle2 , Extent
• SetEndianess() : DAT
• SetEndianessOnSave() : MRC , Spider , MRC , Spider
• SetEntryID() : MMCifInfoStructDetails
• SetEps() : ButterworthLowPassFilter
• SetEpsilon() : Topology
• SetEpsilons() : Topology
• SetException() : TerminiExceptions
• SetExtent() : PixelSampling
• SetFGMDHBondDonorParameters() : Topology
• SetFilename() : StarParser
• SetFixElement() : RuleBasedProcessor
• SetFlags() : QueryViewWrapper
• SetFloatProp() : GenericPropContainer< H >
• SetForcefield() : FFReader
• SetFormat() : TIF
• SetFormula() : Compound
• SetFrameCellSize() : CoordGroupHandle , CoordSource
• SetFrameDelta() : CoordSource
• SetFramePositions() : CoordGroupHandle , CoordSource
• SetFreq() : ProfileColumn
• SetFrequencySampling() : PixelSampling
• SetFudgeLJ() : Forcefield , Topology
• SetFudgeQQ() : Forcefield , Topology
• SetGamma() : Ellipse2 , Hyperbola2
• SetGBSARadii() : Topology
• SetGBSARadius() : Topology
• SetGenPairs() : Forcefield
• SetGeometry() : LineAverageBase
• SetHarmonicAngleParameters() : Topology
• SetHarmonicBondParameters() : Topology
• SetHarmonicDistanceRestraintParameters() : Topology
• SetHarmonicImproperParameters() : Topology
• SetHarmonicPositionRestraintParameters() : Topology
• SetHetAtom() : AtomBase , AtomImpl
• SetID() : MMCifInfoTransOp , MMCifInfoBioUnit , MMCifInfoCitation , MMCifInfoObsolete , MMCifInfoTransOp , MMCifInfoBioUnit , MMCifInfoCitation , MMCifInfoObsolete
• SetInchi() : Compound
• SetInchiKey() : Compound
• SetIndex() : AtomBase , AtomImpl , ResidueView
• SetInsCode() : ResNum
• SetInSequence() : ChainHandle , ChainImpl
• SetIntProp() : GenericPropContainer< H >
• SetISBN() : MMCifInfoCitation
• SetIsLigand() : ResidueImpl , ResidueBase
• SetIsPQR() : PDBWriter
• SetIsProtein() : ResidueBase
• SetKey() : ResidueImpl
• SetLength() : ConnectorImpl
• SetLHS() : LogicOPNode
• SetLimit() : LowPassFilter , HighPassFilter , GaussianLowPassFilter , GaussianHighPassFilter , FermiLowPassFilter , FermiHighPassFilter , ButterworthLowPassFilter
• SetLJPairParameters() : Topology
• SetMass() : MMCifInfoStructDetails , AtomBase , AtomImpl , Topology
• SetMasses() : Topology
• SetMassMethod() : MMCifInfoStructDetails
• SetMaster() : AlignedRegion
• SetMatrix() : Transform , MMCifInfoTransOp
• SetMaximum() : StatBase , StatMinMaxBase
• SetMean() : StatBase
• SetMethod() : MMCifInfo
• SetMethodDetails() : MMCifInfoBioUnit
• SetMinimum() : StatBase , StatMinMaxBase
• SetModelDetails() : MMCifInfoStructDetails
• SetModelTypeDetails() : MMCifInfoStructDetails
• SetModificationDate() : Compound
• SetMutable() : CoordSource
• SetName() : Compound , AtomBase , EntityBase , ChainImpl , EntityImpl , SequenceImpl , SequenceHandle , QSscoreEntity , Table
• SetNames() : Interaction
• SetNode() : Polygon2 , PolygonMask
• SetNormal() : Plane
• SetNormalizeOnSave() : DAT , DF3 , DX , IPL , DX , MRC , PNG , Situs , Spider , TIF , DAT , DF3 , IPL , MRC , PNG , Situs , Spider , TIF
• SetNullModel() : ProfileHandle
• SetNum() : ResNum
• SetNumber() : ResidueImpl
• SetOBCScaling() : Topology
• SetOBCScalings() : Topology
• SetObservedData() : DataObserver
• SetObsoleteInfo() : MMCifInfo
• SetOccupancy() : AtomImpl , AtomBase
• SetOffset() : SequenceImpl , SequenceHandle
• SetOneLetterCode() : Compound , ResidueImpl , ResidueBase , SequenceImpl , SequenceHandle
• SetOP() : LogicOPNode
• SetOrigin() : Rotation3 , Ellipse2 , Hyperbola2 , Sphere
• SetP() : Plane
• SetPageFirst() : MMCifInfoCitation
• SetPageLast() : MMCifInfoCitation
• SetParam() : StereoChemicalParams , Interaction
• SetParent() : Node
• SetPDBID() : MMCifInfoObsolete
• SetPeriodicBoxExtents() : Simulation
• SetPeriodicDihedralParameters() : Topology
• SetPeriodicImproperParameters() : Topology
• SetPhasecolor() : TIF
• SetPhi() : Rotation3
• SetPixel() : RasterImage
• SetPixelSampling() : PixelSampling , Data
• SetPositions() : Simulation
• SetPreprocessorDefinition() : FFReader
• SetPrimaryConnector() : AtomImpl
• SetProtein() : ResidueImpl
• SetPsi() : Rotation3
• SetPublishedIn() : MMCifInfoCitation
• SetPubMed() : MMCifInfoCitation
• SetQ() : GaussianLaplacianFilterBase , GaussianFilterBase , GaussianGradientMagnitudeFilterBase
• SetQuat() : Rotation3
• SetQuery() : QueryViewWrapper
• SetRadius() : Sphere , Circle2 , AtomBase , AtomImpl
• SetReadCanonicalSeqRes() : MMCifReader
• SetReadSeqRes() : PDBReader , MMCifReader , PDBReader
• SetReal() : HalfFrequencyDomain , ImageHandle , ImageStateBase , FrequencyDomain , ImageStateImpl< T, D > , SpatialDomain
• SetReplacedPDBID() : MMCifInfoObsolete
• SetResidueNumber() : EditorBase
• SetResolution() : MMCifInfo
• SetRestrictChains() : MMCifReader
• SetRevisionsDateOriginal() : MMCifInfo
• SetRFree() : MMCifInfo
• SetRHS() : LogicOPNode
• SetRole() : SequenceHandle , SequenceImpl
• SetRot() : Transform
• SetRotationAngle() : Rotation3
• SetRotationAxis() : Rotation3
• SetRotationMatrix() : Rotation3
• SetRWork() : MMCifInfo
• SetSampling() : ImageStateBase , ImageStateImpl< T, D >
• setScaling() : DensityForce
• SetScore() : ContactPredictionScoreResult
• SetSecStructure() : ResidueBase , ResidueImpl
• SetSequence() : ProfileHandle
• SetSequenceName() : AlignmentHandle
• SetSequenceOffset() : AlignmentHandle
• SetSequenceRole() : AlignmentHandle
• SetShift() : FractionalShift
• SetSigma() : GaussianGradientMagnitudeFilterBase , GaussianFilterBase , GaussianLaplacianFilterBase , Topology
• SetSigmas() : Topology
• SetSigned() : DAT , TIF , DAT , TIF
• SetSpatialOrigin() : Data , HalfFrequencyDomain , ImageHandle , ImageStateBase , FrequencyDomain , SpatialDomain , ImageStateImpl< T, D > , NullData
• SetSpatialSampling() : Data , PixelSampling , Data
• SetStandardCTer() : Forcefield
• SetStandardDeviation() : StatBase
• SetStandardNTer() : Forcefield
• SetStart() : Rectangle2 , Extent
• SetStartTime() : CoordSource , CoordGroupHandle
• SetState() : AtomImpl
• SetStop() : ButterworthLowPassFilter
• SetStrictHydrogens() : RuleBasedProcessor
• SetString() : SequenceImpl , SequenceHandle
• SetStringProp() : GenericPropContainer< H >
• SetStructDetails() : MMCifInfo
• SetStructRefs() : MMCifInfo
• SetSubformat() : MRC
• SetSubimage() : TIF , Nanoscope , TIF , Nanoscope
• SetSum() : StatBase
• SetSymmetries() : QSscorer
• SetT() : FermiHighPassFilter , FermiLowPassFilter
• SetTheta() : Rotation3
• SetThresholds() : SliceFnc
• Settings() : Settings
• settings : lDDTScorer , OligoLDDTScorer , MappedLDDTScorer
• SetTitle() : MMCifInfoStructDetails , MMCifInfoCitation , MMCifInfoStructDetails
• SetTMat() : FragmentImpl
• SetTorsionAngle() : ICSEditor
• SetTraced() : AtomImpl
• SetTrans() : Transform
• SetTransform() : XCSEditor , EntityHandle , EntityImpl , XCSEditor
• SetType() : MMCifInfoTransOp , ChainImpl , MMCifInfoTransOp
• SetTypes() : Interaction
• SetUnkAtomTreatment() : RuleBasedProcessor
• SetUnkResidueTreatment() : RuleBasedProcessor
• setUp() : XMLTestRunnerTest
• SetUreyBradleyAngleParameters() : Topology
• SetVariance() : StatBase
• SetVec3Prop() : GenericPropContainer< H >
• SetVector() : MMCifInfoTransOp
• SetVelocities() : Simulation
• SetVisited() : AtomImpl
• SetVolume() : MMCifInfoCitation
• SetW() : Vec4
• SetWeight() : SubstWeightMatrix
• SetWriteMultiModel() : PDBWriter
• SetX() : Vec4 , Vec3 , Vec2
• SetY() : Vec2 , Vec4 , Vec3
• SetYear() : MMCifInfoCitation
• SetZ() : Vec3 , Vec4
• SetZeroOccTreatment() : Processor
• SharedPtrType : ImageStateImpl< T, D >
• Shift() : SphericalMask
• shift : GDTResult
• Shift() : Extent , PolygonMask , CompositeMask , MaskBase , ExtentMask , InvertedMask , CircleMask
• ShiftFnc() : ShiftFnc
• ShiftLeft() : AlignedRegion
• ShiftRegion() : AlignmentHandle , SequenceImpl
• ShiftRight() : AlignedRegion
• Shrink() : MaskBase
• SIGNCOLOR : RasterImage
• SimilarityMatrix() : SimilarityMatrix
• Simulation() : Simulation
• SinFnc() : SinFnc
• Situs() : Situs
• Size() : Size
• size() : PagedArray< T, P >
• Size() : Size
• size() : FixedString< LENGTH >
• Size() : Size
• size() : ProfileDB , ProfileHandle , StringRef
• Size() : Size
• size() : PodVector< T >
• Size() : Size
• size() : AdjacencyBitmap
• Size() : Size
• SizeRule : Transformation
• skewness_ : StatBase
• Slice() : SequenceList , ConstSequenceList , SequenceListImpl
• SliceFnc() : SliceFnc
• SmoothMaskImageBase() : SmoothMaskImageBase
• solute_dielectric : Settings
• solvent_dielectric : Settings
• Sort() : Table
• sorted_indices : ContactPredictionScoreResult
• SpatialDomain() : SpatialDomain
• SpatialOrganizer() : SpatialOrganizer< ITEM, VEC >
• SpearmanCorrel() : Table
• Sphere() : Sphere
• SphericalMask() : SphericalMask
• Spider() : Spider
• split() : StringRef
• split_expression : TableSelector
• SplitLine() : StarParser
• SqrtFnc() : SqrtFnc
• ss_score : HHblitsHit
• ss_type : SecStructureSegment
• StarDataItem() : StarDataItem
• StarLoopDesc() : StarLoopDesc
• StarParser() : StarParser
• startTest() : _XMLTestResult
• StatAccumulator() : StatAccumulator< MAX_MOMENT, DATATYPE >
• StatBase() : StatBase
• StateApply() : ImageHandle , ImageList , ImageHandle , ConstImageHandle , ImageList , ConstImageHandle , ImageHandle , ConstImageHandle , ImageList , ConstImageHandle , ImageList
• StateApplyIP() : ImageList , ImageHandle , ImageList , ImageHandle , ImageList , ImageHandle
• StateType : ImageStateImpl< T, D >
• StatMinMaxBase() : StatMinMaxBase
• Stats() : Table
• std_dev_ : StatBase
• StdDev() : Table
• Steps() : Simulation
• StereoChemicalAngleViolation() : StereoChemicalAngleViolation
• StereoChemicalBondViolation() : StereoChemicalBondViolation
• StereoChemicalProps() : StereoChemicalProps
• StereoChemistryInfo() : StereoChemistryInfo
• stopTest() : _XMLTestResult
• StoreExpression() : MMCifReader
• StoreRange() : MMCifReader
• str() : StringRef , StringOrRegexParam
• str_no_whitespace() : StringRef
• Stream() : BinaryDataSource , BinaryDataSink
• StreamLogSink() : StreamLogSink
• strict_interactions : Settings
• STRING : Prop
• StringLogSink() : StringLogSink
• StringOrRegexParam() : StringOrRegexParam
• StringRef() : StringRef
• Submit() : PreparedStatement
• subst_weights : AlignmentOpts
• substr() : StringRef
• SubstWeightMatrix() : SubstWeightMatrix
• Sum() : Table
• sum_ : StatBase
• superposition() : QSscorer
• SuperpositionResult() : SuperpositionResult
• SUPPORTED_TYPES : Table
• SurfaceHandle() : SurfaceHandle
• SurfaceImpl() : SurfaceImpl
• SurfaceVertex() : SurfaceVertex
• Swap() : EntityImpl , ValueHolder< V > , ImageHandle , SpatialOrganizer< ITEM, VEC > , EntityHandle
• swap() : MeanSquareMinimizer
• Switch() : ConnectorImpl
• SwitchAtomPos() : ResidueHandle , ResidueImpl
• symm_1() : QSscorer
• symm_2() : QSscorer