- r -

• Range() : Range
• RangeHandler() : RangeHandler
• RasterImage() : RasterImage
• raw_set() : PodVector< T >
• rbegin() : PodVector< T >
• read() : BinaryIStream< CONVERSIONTYPE >
• Read() : AssemblyInfo
• read() : BinaryIStream< CONVERSIONTYPE >
• Read() : PagedArray< T, P >
• read() : BinaryIStream< CONVERSIONTYPE >
• read_helper() : BinaryIStream< CONVERSIONTYPE >
• ReadCHARMMPRM() : FFReader
• ReadCHARMMRTF() : FFReader
• ReadGromacsForcefield() : FFReader
• ReadITP() : FFReader
• ReadResidueDatabase() : FFReader
• Reciproce() : ImageHandle
• Rectangle2() : Rectangle2
• reduce() : Phase
• Ref() : PtrObserver< T >
• ReferenceCalcDensityForceKernel() : ReferenceCalcDensityForceKernel
• RefreshSortedIndices() : ContactPredictionScoreResult
• Register() : Progress , Simulation
• RegisterFactory() : IOManager
• ReleaseDataPtr() : RasterImage
• Remove() : AminoAcidSet , SpatialOrganizer< ITEM, VEC >
• RemoveAssembly() : LinearIndexer
• RemoveAtom() : EntityView , BuildingBlock , ResidueView
• RemoveAtomInternal() : EntityView
• RemoveAtoms() : ResidueView
• RemoveBond() : EntityView
• RemoveBondInternal() : AtomView
• RemoveBonds() : AtomView
• RemoveChain() : EntityView
• RemoveCol() : Table
• RemoveInteractionsToNext() : BuildingBlock
• RemoveInteractionsToPrev() : BuildingBlock
• RemoveProfiles() : IOProfileRegistry
• RemoveProp() : GenericPropContainerImpl , GenericPropContainer< H >
• RemoveResidue() : ChainView , EntityView
• RemoveResidues() : ChainView
• RemoveSequence() : AlignmentHandle , SequenceListImpl
• RemoveSink() : MultiLogSink
• RenameAtom() : EditorBase
• RenameChain() : EditorBase , EntityImpl
• RenameCol() : Table
• RenameResidue() : EditorBase
• rend() : PodVector< T >
• RenumberAllResidues() : EditorBase , ChainImpl , EntityImpl
• RenumberChain() : EditorBase , EntityImpl
• ReorderAllResidues() : EditorBase , EntityImpl
• ReorderAtoms() : Processor
• ReorderResidues() : EditorBase , ChainImpl
• Replace() : AlignedRegion , AlignmentHandle , SequenceImpl
• ReplaceAtom() : Interaction , BuildingBlock
• Repr() : lDDTLocalScore
• RequiresBuilder() : EntityIOPQRHandler
• RequiresProcessor() : EntityIOMAEHandler , EntityIOCRDHandler , EntityIOHandler , EntityIOMAEHandler , EntityIOMMCIFHandler , EntityIOPDBHandler , EntityIOSDFHandler , EntityIOCRDHandler , EntityIOHandler , EntityIOMMCIFHandler , EntityIOPDBHandler , EntityIOSDFHandler
• reserve() : PodVector< T >
• Reset() : Transform , ImageHandle , QueryState
• ResetCharge() : Simulation
• ResetDistanceConstraint() : Simulation
• ResetExclusions() : Topology
• ResetGBSA() : Simulation
• ResetHarmonicAngle() : Simulation
• ResetHarmonicBond() : Simulation
• ResetHarmonicDistanceRestraint() : Simulation
• ResetHarmonicImproper() : Simulation
• ResetHarmonicPositionRestraint() : Simulation
• ResetLJ() : Simulation
• ResetLJPair() : Simulation
• ResetMass() : Simulation
• ResetPeriodicDihedral() : Simulation
• ResetPeriodicImproper() : Simulation
• ResetPositionConstraints() : Topology , Simulation
• ResetSinks() : Logger
• ResetUreyBradleyAngle() : Simulation
• Residue() : Builder
• ResidueBase() : ResidueBase
• ResidueHandle() : ResidueHandle
• ResidueImpl() : ResidueImpl
• ResidueNames() : ResidueNames
• ResidueView() : ResidueView
• ResNum() : ResNum
• Rhythm() : Observer , TrajObserver , TrajWriter
• right() : binary_dispatch_op< FNC > , binary_dispatch_ip< FNC >
• RingFinder() : RingFinder
• RingsPerceived() : RingFinder
• Rotate() : Quat
• Rotate2D() : Rotate2D
• Rotate2D90() : Rotate2D90
• RotateAngle() : TorsionImpl
• RotateTorsionAngle() : ICSEditor
• Rotation3() : Rotation3
• RowMean() : Table
• RowSet() : RowSet< R >
• RPadded() : RPadded
• rtrim() : StringRef
• RuleBasedProcessor() : RuleBasedProcessor
• run() : XMLTestRunner