- s -

• Save() : ReducedPotential , ReducedStatistics
• SaveToFile() : InteractionStatistics , TorsionStatisticsSolis , TorsionPotential , PackingPotential , TorsionStatistics , AllAtomPotential , PackingStatistics , TorsionPotentialSolis
• SDFReader() : SDFReader
• SDFWriter() : SDFWriter
• SecStructure() : SecStructure
• SecStructureSegment() : SecStructureSegment
• Select() : EntityHandle , EntityView , EntityImpl , ResidueHandle , ResidueView , ChainHandle , ChainView
• SelNode() : SelNode
• SelStmt() : SelStmt
• SequenceHandle() : SequenceHandle
• SequenceImpl() : SequenceImpl
• SequenceList() : SequenceList
• SequenceListImpl() : SequenceListImpl
• SequenceListIterator() : SequenceListIterator< T, I >
• SequencesHaveEqualLength() : SequenceListImpl , ConstSequenceList , SequenceList
• Serialize() : PackingPotentialOpts , PackingPotential , PackingStatistics , ReducedPotential , ReducedStatOptions , ReducedStatistics , TorsionPotentialOptsSolis , TorsionPotentialSolis , TorsionStatisticsSolis , TorsionPotentialOpts , TorsionPotential , TorsionStatistics , FixedString< LENGTH > , AllAtomPotentialOpts , AllAtomPotential , AminoAcidSet , InteractionStatistics , NullType , IntegralClassifier , ContinuousClassifier , MultiClassifier< V, T1, T2, T3, T4, T5, T6, T7 >
• SerializeHelper() : SerializeHelper< false, T > , SerializeHelper< true, T >
• SerializeWriteHelper() : SerializeWriteHelper< false, T > , SerializeWriteHelper< true, T >
• Set() : IOProfileRegistry , InteractionStatistics , MultiClassifier< V, T1, T2, T3, T4, T5, T6, T7 > , TriMatrix< T >
• SetA() : Ellipse2 , Hyperbola2
• SetAngle() : ICSEditor , EntityImpl , TorsionImpl , TorsionHandle
• SetAngleICS() : Dihedral
• SetAnisou() : AtomBase , AtomImpl
• SetAtom() : FragmentImpl
• SetAtomOriginalPos() : XCSEditor
• SetAtomPos() : CoordGroupHandle , CoordSource , XCSEditor
• SetAttribute() : InfoGroup , InfoHandle , EleImpl , InfoItem
• SetB() : Ellipse2 , Hyperbola2
• SetBFactor() : AtomBase , AtomImpl
• SetBitDepth() : DAT , TIF
• SetBondLength() : ICSEditor
• SetBondOrder() : BondHandle , ConnectorImpl
• SetBool() : InfoItem
• SetBoolProp() : GenericPropContainer< H >
• SetBoolRepr() : EleImpl
• SetCategory() : StarLoopDesc
• SetCenter() : Circle2 , Transform
• SetCharge() : AtomBase , AtomImpl
• SetChemClass() : Compound , ResidueImpl , ResidueBase
• SetCompoundLib() : ChemdictParser
• SetCreationDate() : Compound
• SetDefaultBuilder() : Conopology
• SetDialect() : Builder , Compound , RuleBasedBuilder
• SetDir() : ConnectorImpl
• SetDirAndLength() : ConnectorImpl
• SetElement() : AtomBase , AtomImpl
• SetEnd() : Rectangle2
• SetEndianess() : DAT
• SetEndianessOnSave() : MRC , Spider
• SetFlags() : QueryViewWrapper
• SetFloat() : InfoItem
• SetFloatProp() : GenericPropContainer< H >
• SetFloatRepr() : EleImpl
• SetFormat() : TIF
• SetFormula() : Compound
• SetFramePositions() : CoordGroupHandle
• SetGamma() : Ellipse2 , Hyperbola2
• SetHetAtom() : AtomBase , AtomImpl
• SetIndex() : AtomImpl , ResidueView
• SetInsCode() : ResNum
• SetInt() : InfoItem
• SetIntProp() : GenericPropContainer< H >
• SetIntRepr() : EleImpl
• SetIsLigand() : ResidueImpl , ResidueBase
• SetIsPQR() : PDBWriter
• SetIsProtein() : ResidueBase
• SetKey() : ResidueImpl
• SetLength() : ConnectorImpl
• SetLHS() : LogicOPNode
• SetMass() : AtomBase , AtomImpl
• SetMaster() : AlignedRegion
• SetMaximum() : ImageFormatBase
• SetMinimum() : ImageFormatBase
• SetModificationDate() : Compound
• SetMutable() : CoordSource
• SetName() : InfoGroup , AtomBase , InfoHandle , EleImpl , InfoItem , EntityBase , AtomImpl , ChainImpl , EntityImpl , SequenceImpl , SequenceHandle
• SetNewType() : EleImpl
• SetNext() : ConnResEntry
• SetNode() : Polygon2
• SetNormal() : Plane
• SetNormalizeOnSave() : DF3 , Situs , DAT , DX , MRC , PNG , Spider , TIF
• SetNum() : ResNum
• SetNumber() : ResidueImpl
• SetOccupancy() : AtomBase , AtomImpl
• SetOffset() : SequenceHandle , SequenceImpl
• SetOneLetterCode() : Compound , ResidueImpl , ResidueBase , SequenceHandle , SequenceImpl
• SetOP() : LogicOPNode
• SetOrigin() : Ellipse2 , Plane , Sphere , Rotation3 , Hyperbola2
• SetOriginalPos() : AtomImpl
• SetParent() : Node
• SetPhasecolor() : TIF
• SetPhi() : Rotation3
• SetPrev() : ConnResEntry
• SetPrimaryConnector() : AtomImpl
• SetProtein() : ResidueImpl
• SetPsi() : Rotation3
• SetQuat() : Rotation3
• SetQuery() : QueryViewWrapper
• SetRadius() : Sphere , AtomBase , Circle2 , AtomImpl
• SetRHS() : LogicOPNode
• SetRot() : Transform
• SetRotationAngle() : Rotation3
• SetRotationAxis() : Rotation3
• SetRotationMatrix() : Rotation3
• SetSecStructure() : ResidueBase , ResidueImpl
• SetSequenceName() : AlignmentHandle
• SetSequenceOffset() : AlignmentHandle
• SetSequenceSeparation() : AllAtomPotential
• SetSigned() : DAT , TIF
• SetStart() : Rectangle2
• SetState() : AtomImpl
• SetStrictHydrogenMode() : Builder
• SetString() : SequenceImpl , SequenceHandle
• SetStringProp() : GenericPropContainer< H >
• SetStringRepr() : EleImpl
• SetSubformat() : MRC
• SetSubimage() : Nanoscope , TIF
• SetTextData() : EleImpl , InfoGroup , InfoHandle
• SetTheta() : Rotation3
• SetTMat() : FragmentImpl
• SetTorsionAngle() : ICSEditor
• SetTraced() : AtomImpl
• SetTrans() : Transform
• SetTransform() : EntityImpl , XCSEditor
• SetTransformedPos() : AtomImpl
• SetType() : InfoItem , EleImpl
• SetValue() : InfoItem
• SetVecRepr() : EleImpl
• SetVector() : InfoItem
• SetVisited() : AtomImpl
• SetW() : Vec4
• SetWeight() : SubstWeightMatrix
• SetWriteMultiModel() : PDBWriter
• SetX() : Vec4 , Vec2 , Vec3
• SetY() : Vec2 , Vec3 , Vec4
• SetZ() : Vec3 , Vec4
• ShiftLeft() : AlignedRegion
• ShiftRegion() : SequenceImpl , AlignmentHandle
• ShiftRight() : AlignedRegion
• Situs() : Situs
• size() : FixedString< LENGTH > , PodVector< T > , StringRef
• SkipEmpty() : ResidueHandleIter , ResidueViewIter
• Slice() : SequenceListImpl , SequenceList , ConstSequenceList
• SpatialOrganizer() : SpatialOrganizer< ITEM, VEC >
• Sphere() : Sphere
• Spider() : Spider
• split() : StringRef
• SplitLine() : StarParser
• StarDataItem() : StarDataItem
• StarLoopDesc() : StarLoopDesc
• StarParser() : StarParser
• str() : StringRef
• Stream() : BinaryDataSink , BinaryDataSource
• StreamLogSink() : StreamLogSink
• StringRef() : StringRef
• Strip() : InfoPath
• Submit() : PreparedStatement
• substr() : StringRef
• SubstWeightMatrix() : SubstWeightMatrix
• SuperposerSVD() : SuperposerSVD
• SuperpositionResult() : SuperpositionResult
• SurfaceHandle() : SurfaceHandle
• SurfaceImpl() : SurfaceImpl
• SurfaceVertex() : SurfaceVertex
• Swap() : EntityImpl , EntityHandle , SpatialOrganizer< ITEM, VEC >
• Switch() : ConnectorImpl
• SwitchAtomPos() : ResidueImpl , ResidueHandle